Molecular characterization of Lotus corniculatus cultivars using transferable microsatellite markers



Título del documento: Molecular characterization of Lotus corniculatus cultivars using transferable microsatellite markers
Revista: Ciencia e investigación agraria
Base de datos: PERIÓDICA
Número de sistema: 000345409
ISSN: 0304-5609
Autores: 1
1
1
2
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1
Instituciones: 1Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria, Unidad de Biotecnología, Canelones. Uruguay
2Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria, Programa Nacional de Pasturas y Forrajes, Colonia. Uruguay
Año:
Periodo: Sep-Dic
Volumen: 38
Número: 3
Paginación: 453-461
País: Chile
Idioma: Inglés
Tipo de documento: Nota breve o noticia
Enfoque: Experimental, analítico
Resumen en español Lotus corniculatus L. es la especie de mayor importancia agronómica en el género Lotus y la de mayor distribución a nivel mundial. Los genotipos de L. corniculatus forman grupos genéticos complejos y difíciles de reconocer tanto morfológica como bioquímicamente. Dado el proceso largo y costoso de aislar secuencias simples repetidas (SSR, microsatélites), resulta altamente atractiva la posibilidad de utilizar microsatélites ya identificados en una especie relacionada. El objetivo del trabajo fue la identificación y validación de marcadores microsatélites transferibles y la caracterización molecular de cuatro cultivares. Cada cultivar de L. corniculatus fue representado por 15 genotipos. Se evaluaron 10 marcadores microsatélites provenientes de L. japonicus L. Se comprobó la transferibilidad de marcadores de L. japonicus en L. corniculatus. Se detectaron un total de 29 alelos para los 4 microsatélites trasferibles seleccionados, mientras que el promedio de alelos por locus fue de 7,25. El marcador TM0197 fue el que menos alelos presentó (5 alelos) y el TM0083 el que más presentó (10 alelos). El contenido de información polimórfica (PIC) para los marcadores seleccionados varió entre 0,19 y 0,35 calificando en el rango de altamente informativos. Se comprobó una alta variabilidad entre individuos del mismo cultivar. El empleo de marcadores microsatélites puede ser de gran utilidad para diferenciar individuos a un bajo costo, presentando un gran potencial para su uso en mejoramiento
Resumen en inglés Lotus corniculatus L. is the most important agricultural species in the genus Lotus and is the most widely distributed Lotus species worldwide. L. corniculatus genotypes form complex groups that are difficult to recognize both morphologically and biochemically. Given the extensive and expensive process of isolating Simple Sequence Repeats (SSR, also called microsatellites), the possibility of using microsatellites already identified in related species is highly attractive. The aim of this work was the identification and validation of transferable microsatellite markers in L. corniculatus, and using those markers to study the genetic variability among four cultivars. Each cultivar of L. corniculatus was represented by 15 genotypes. Ten microsatellite markers were evaluated, and from those, four were selected based on their discriminative values observed among cultivars. We detected 29 alleles for the four markers, and there was an average of 7.25 alleles per locus. The marker TM0197 had the fewest number of alleles (5) and TM0083 had the highest number of alleles (10). The polymorphic information content (PIC) for the selected markers varied from 0.19 to 0.35, and the markers were therefore classified as highly informative. Based on the markers, we found high variability between individuals of the same cultivar. The use of transferable microsatellite markers could be useful to differentiate individuals at a relatively low cost, showing a great potential for use in breeding programs
Disciplinas: Agrociencias
Palabras clave: Leguminosas,
Genética,
Lotus corniculatus,
Forraje,
Marcadores moleculares,
Variabilidad genética,
Microsatélites,
Transferencia génica
Keyword: Agricultural sciences,
Legumes,
Genetics,
Lotus corniculatus,
Feedstuff,
Molecular markers,
Genetic variability,
Microsatellites,
Gene transfer
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