Análisis taxonómico con variables mixtas en líneas de malanga (Xanthosoma spp.) y plátano (Musa spp.)



Título del documento: Análisis taxonómico con variables mixtas en líneas de malanga (Xanthosoma spp.) y plátano (Musa spp.)
Revista: Centro agrícola
Base de datos: PERIÓDICA
Número de sistema: 000405208
ISSN: 0253-5785
Autores: 1
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Instituciones: 1Instituto de Investigaciones de Viandas Tropicales, Santo Domingo, Villa Clara. Cuba
2Universidad Central "Marta Abreu" de Las Villas, Santa Clara, Villa Clara. Cuba
Año:
Periodo: Oct-Dic
Volumen: 40
Número: 4
Paginación: 7-10
País: Cuba
Idioma: Español
Tipo de documento: Nota breve o noticia
Enfoque: Analítico, descriptivo
Resumen en español El presente trabajo tuvo como objetivo comparar el desempeño de cuatro métodos de aglomeración jerárquicos en varias estructuras de datos, para determinar cuál método y topología son más consistentes al clasificar un grupo de genotipos de malanga ( Xanthosoma spp.) y plátanos ( Musa spp.) a partir de los rasgos que los caracterizan. En el primer procedimiento se realizó un estudio de la métrica de Gower para variables mixtas la cual se combinó con cuatro métodos de aglomeración y en el segundo se integraron las variables cualitativas transformadas a través del análisis de correspondencia múltiple con las cuantitativas normalizadas, en un análisis de conglomerados usando al igual que en el anterior, cuatro métodos de aglomeración: Promedio, Ward, agrupación de enlace completo y agrupación de enlace simple combinado a la vez con dos medidas de distancias ( Euclidiana y Manhattan ). Las diferentes estructuras fueron evaluadas con el coeficiente de correlación cofenética. Para los diferentes análisis se utilizaron funciones implementadas sobre la base del lenguaje de programación R. En está investigación se determinó que para ambos procedimientos con las medidas de distancias de Gower y Euclidiana el método de aglomeración Promedio es el que mantiene una mejor estabilidad en las estructuras obtenidas
Resumen en inglés This study aims to compare the performance of four hierarchical clustering methods on several data structures to determine which method and topology is more consistent in classifying a taro ( Xanthosoma spp.) genotype group and plantains ( Musa spp.) from their characteristic traits. In the first method, a study is carried out on the Gower metric method for mixed variables which is combined with four other agglomeration methods and the second integrate transformed qualitative variables through multiple correspondence analysis with standardized quantitative variables, in a clustering analysis using, like the above, four agglomeration methods: average, Ward or minimum variance, Complete Linkage Agglomerative Clustering and Single Linkage Agglomerative Clustering combining at the same time with two distance measurements ( Euclidean and Manhattan ). Different structures were evaluated with the cophenetic correlation coefficient. For different analysis, implemented functions were used on the basis of the R programming language. In this research, it was determined that for both procedures with Gower and Euclidean distance measures, the average agglomeration method maintains better stability in the structures obtained
Disciplinas: Agrociencias,
Ciencias de la computación
Palabras clave: Frutales,
Plantas para uso industrial,
Programación,
Malanga,
Xanthosoma,
Plátano,
Musa,
Análisis taxonómico,
Bancos de germoplasma,
Taxonomía numérica
Keyword: Agricultural sciences,
Computer science,
Fruit trees,
Plants for industrial use,
Programming,
Tanier,
Xanthosoma,
Banana,
Musa,
Taxonomic analysis,
Germplasm banks,
Numerical taxonomy
Texto completo: Texto completo (Ver PDF)