DNA sequence variation in the fruit tree Inga inicuil (Leguminosae: Mimosoideae) from contrasting altitude distinguishes two different species



Título del documento: DNA sequence variation in the fruit tree Inga inicuil (Leguminosae: Mimosoideae) from contrasting altitude distinguishes two different species
Revista: Botanical Sciences
Base de datos: PERIÓDICA
Número de sistema: 000448008
ISSN: 2007-4298
Autores: 1
2
3
2
Instituciones: 1Centro de Investigación Científica de Yucatán A.C., Unidad de Recursos Naturales, Mérida, Yucatán. México
2Instituto de Ecología, A.C., Red de Biodiversidad y Sistemática, Jalapa, Veracruz. México
3Colegio de Postgraduados, Campus Veracruz, Tepetates, Veracruz. México
Año:
Periodo: Oct-Dic
Volumen: 94
Número: 4
Paginación: 673-686
País: México
Idioma: Inglés
Tipo de documento: Artículo
Enfoque: Experimental, aplicado
Resumen en español Antecedentes: Inga inicuil es una leguminosa arbórea en Veracruz, México cuyo fruto se comercializa localmente. Una hipótesis taxonómica sugiere que I. inicuil es una especie con amplio rango altitudinal, mientras que otra segrega I. paterno de I. inicuil por su altitud y morfología. El objetivo de este estudio fue explorar la variación en regiones no codificadoras del cloroplasto y núcleo en individuos de I. inicuil de altitud contrastante. Hipótesis: Análisis filogenéticos con secuencias génicas separarán ejemplares de I. inicuil en dos especies diferentes, como en otros metabolitos el contenido de azúcar en la sarcotesta variará con la altitud. Especie en estudio: Inga inicuil Sitio de estudio: La región montañosa de Coatepec y la región costera de Tolome y San Pancho en Veracruz, México. Métodos: Se seleccionaron individuos de I. inicuil de localidades con altitud contrastante. Se utilizó Máxima Verosimilitud e Inferencia Filogenética Bayesiana para los análisis filogenéticos con las secuencias del ITS15.8S-ITS2 y del trnL-F. El contenido de azúcar en la fruta madura se midió con un refractómetro. Resultados: El contenido de azúcar no está relacionado con altitud o variación de las secuencias. Sin embargo, las secuencias del trnL-F revelaron una inserción/deleción de aproximadamente 309 nucleótidos solo en los árboles que crecen en la planicie costera. Los análisis filogenéticos apoyan la hipótesis de que I. inicuil e I. paterno son dos especies diferentes. Conclusiones: Las notables diferencias en los datos de secuencias del trnL-F hacen necesario investigación adicional aumentando el muestreo a lo largo del rango de distribución de esta especie para aclarar su taxonomía
Resumen en inglés Background: Inga inicuil is a leguminous tree in Veracruz, Mexico whose fruits are locally commercialized. One taxonomic hypothesis suggests that I. inicuil is a species with a wide altitudinal range, while another segregates I. paterno from I. inicuil by altitude and morphology. The aim of this study was to explore variation in non-coding regions from the chloroplast and nuclear genomes within individuals of I. inicuil from contrasting altitude. Hypothesis: Phylogenetic analyses with sequence data would separate exemplars of I. inicuil in two different species and as the case with other metabolites, the sugar content in the sarcotesta would vary with altitude. Studied species: Inga inicuil Study site: The mountainous region of Coatepec and the coastal region of Tolome and San Pancho in Veracruz, Mexico. Methods: Representative individuals of I. inicuil were selected from localities with contrasting altitude. Maximum Likelihood and Bayesian Phylogenetic Inference approaches were used for phylogenetic analyses with sequence data from the ITS1-5.8S-ITS2 and trnL-F. Sugar content in ripe fruit was measured using a refractometer. Results: Sugar content was not related to altitude or with sequence variation. However, sequences from the trnL-F revealed an insertion/deletion of approximately 309 nucleotides present only in trees growing at the coastal plain. Phylogenetic analyses with sequence data support the hypothesis that I. inicuil and I. paterno are two different species. Conclusions: The remarkable differences of sequence data from the trnL-F within the species make necessary further research increasing taxon sampling along with its distribution range for clarifying its taxonomy
Disciplinas: Biología
Palabras clave: Angiospermas,
Genética,
Evolución y filogenia,
Arboles frutales,
Secuencia génica,
ADN,
Filogenia molecular,
Inga inicuil,
Leguminosae
Keyword: Angiosperms,
Genetics,
Evolution and phylogeny,
Fruit trees,
Gene sequence,
DNA,
Molecular phylogeny,
Inga inicuil,
Leguminosae
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