| Revista: | Boletín médico del Hospital Infantil de México |
| Base de datos: | PERIÓDICA |
| Número de sistema: | 000426031 |
| ISSN: | 1665-1146 |
| Autores: | Herrera, Yesenia1 Contreras, Sandra1 Hernández, Magdalena1 Alvarez, Laura2 Mora, Yolanda1 Encarnación Guevara, Sergio1 |
| Instituciones: | 1Universidad Nacional Autónoma de México, Centro de Ciencias Genómicas, Cuernavaca, Morelos. México 2Universidad Autónoma del Estado de Morelos, Centro de Investigaciones Químicas, Cuernavaca, Morelos. México |
| Año: | 2017 |
| Periodo: | May-Jun |
| Volumen: | 74 |
| Número: | 3 |
| País: | México |
| Idioma: | Inglés |
| Tipo de documento: | Artículo |
| Enfoque: | Experimental, aplicado |
| Resumen en español | Introducción: Un proceso clave en la regulación celular es la fosforilación de proteínas, que se lleva a cabo por cinasas y fosfatasas. Sin embargo, los estudios de fosfoproteómica son difíciles debido a la complejidad de la fosforilación proteica y el número de sitios de fosforilación. Métodos: En el presente trabajo se describe una eficiente estrategia metodológica para analizar fosfopéptidos de proteínas separadas mediante electroforesis bidimensional. En este método, una columna con microesferas de dióxido de titanio (TiO2/NuTip) se utilizó para atrapar los fosfopéptidos en la superficie del TiO2 previamente empacado en una punta. El uso de desplazadores en el buffer de carga, como el ácido láctico, mejoró significativamente la selectividad. Resultados: Los resultados se obtuvieron mediante la comparación de los espectros de masas de péptidos proteolíticos de proteínas analizados utilizando un instrumento de desorción/ionización láser asistida por matriz-tiempo de vuelo (MALDI-TOF). Conclusiones: Este método se ha aplicado para la identificación de fosfoproteínas involucradas en la simbiosis del Rhizobium etli con Phaseolus vulgaris |
| Resumen en inglés | Background: A key process in cell regulation is protein phosphorylation, which is catalyzed by protein kinases and phosphatases. However, phosphoproteomics studies are difficult because of the complexity of protein phosphorylation and the number of phosphorylation sites. Methods: We describe an efficient approach analyzing phosphopeptides in single, separated protein by two-dimensional gel electrophoresis. In this method, a titanium oxide (TiO2)-packed NuTip is used as a phosphopeptide trap, together with displacers as lactic acid in the loading buffer to increase the efficiency of the interaction between TiO2 and phosphorylated peptides. Results: The results were obtained from the comparison of mass spectra of proteolytic peptides of proteins with a matrix-assisted laser desorption-ionization-time of flight (MALDI-TOF) instrument. Conclusions: This method has been applied to identifying phosphoproteins involved in the symbiosis Rhizobium etli-Phaseolus vulgaris |
| Disciplinas: | Biología, Química |
| Palabras clave: | Bioquímica, Fosfoproteínas, Electroforesis bidimensional, Bacterias Gram negativas, Cromatografía de afinidad, Oxidos metálicos, Espectrometría de masas, MALDI-TOF |
| Keyword: | Biochemistry, Phosphoproteins, Bidimensional electrophoresis, Gram negative bacteria, Affinity chromatography, Metal oxides, Mass spectrometry, MALDI-TOF |
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