| Revista: | Acta biológica colombiana |
| Base de datos: | PERIÓDICA |
| Número de sistema: | 000343064 |
| ISSN: | 0120-548X |
| Autores: | González, F1 Caicedo, J.C1 Cruz Roa, A1 Camargo, J1 Spinel, C2 |
| Instituciones: | 1Universidad Nacional de Colombia, Facultad de Ingeniería, Bogotá. Colombia 2Universidad Nacional de Colombia, Centro Internacional de Física, Bogotá. Colombia |
| Año: | 2010 |
| Periodo: | Sep-Dic |
| Volumen: | 15 |
| Número: | 3 |
| Paginación: | 221-233 |
| País: | Colombia |
| Idioma: | Inglés |
| Tipo de documento: | Artículo |
| Enfoque: | Experimental, analítico |
| Resumen en español | Las imágenes histológicas son un importante recurso para la investigación, la educación y la práctica médica. La disponibilidad de imágenes individuales o colecciones de imágenes de referencia está limitada a formatos impresos como libros y revistas científicas. En aquellos casos en donde se publican conjuntos de imágenes digitales, éstos están compuestos por algunas cuantas decenas de imágenes que no representan la gran diversidad de estructuras biológicas que pueden encontrarse en los tejidos fundamentales. Contar con una completa colección de imágenes histológicas es de gran apoyo para los procesos de investigación y educación en diferentes áreas de la medicina, biología y ciencias. En este trabajo se presenta el proceso de adquisición de una colección de 20.000 imágenes histológicas en formato digital, desde la preparación y fijación de los tejidos hasta su digitalización bajo el microscopio, con el propósito de publicarlas como material de referencia para la comunidad académica en general. Además, se presenta el diseño y la arquitectura de un sistema para consultar y explorar la colección de imágenes, utilizando herramientas de búsqueda basadas en el contenido de las imágenes y en las anotaciones provistas por los expertos. El sistema también ofrece novedosos mecanismos de visualización de las imágenes, para facilitar la tarea de identificar las imágenes interesantes entre otros cientos posibles en la colección. El sistema fue desarrollado usando una arquitectura orientada a servicios y ofrece acceso a través de la Web en http://www.informed.unal.edu.co |
| Resumen en inglés | Histology images are an important resource for research, education and medical practice. The availability of image collections with reference purposes is limited to printed formats such as books and specialized journals. When histology image sets are published in digital formats, they are composed of some tens of images that do not represent the wide diversity of biological structures that can be found in fundamental tissues. Making a complete histology image collection available to the general public having a great impact on research and education in different areas such as medicine, biology and natural sciences. This work presents the acquisition process of a histology image collection with 20,000 samples in digital format, from tissue processing to digital image capturing. The main purpose of collecting these images is to make them available as reference material to the academic comunity. In addition, this paper presents the design and architecture of a system to query and explore the image collection, using content-based image retrieval tools and text-based search on the annotations provided by experts. The system also offers novel image visualization methods to allow easy identification of interesting images among hundreds of possible pictures. The system has been developed using a service-oriented architecture and allows web-based access in http://www.informed.unal.edu.co |
| Disciplinas: | Medicina |
| Palabras clave: | Anatomía e histología, Histología, Imágenes, Atlas virtual, Contenidos académicos |
| Keyword: | Medicine, Neurology, Public health, Anatomy and histology, Histology, Images, Virtual atlas, Academic contents |
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