| Revista: | Visao academica |
| Base de datos: | PERIÓDICA |
| Número de sistema: | 000442972 |
| ISSN: | 1518-5192 |
| Autors: | Oliani, Luisa Cunha1 Gabriel, Jane Eyre1 |
| Institucions: | 1Universidade Federal do Vale do Sao Francisco, Petrolina, Pernambuco. Brasil |
| Any: | 2019 |
| Període: | Jul-Sep |
| Volum: | 20 |
| Número: | 3 |
| Paginació: | 19-28 |
| País: | Brasil |
| Idioma: | Portugués |
| Tipo de documento: | Artículo |
| Enfoque: | Analítico, prospectivo |
| Resumen en inglés | The objective of this study was to investigate the phylogenetic relationships among vertebrates from differences in the chemical nature of amino acid residues of the homeotic protein HoxA by comparative analyses of multiple alignments. Search and selectionof the sequences of interest of 18 animals were performed from biological information database. Amino acid residues were aligned using program Clustal Omega, followed by constructing dendogram demonstrating phylogenetic relationships among animals selected. Comparative alignments of the protein HoxA revealed a maximum identity of 35.593% among different vertebrates. Moreover, the dendogram of phylogenetic relationships showed the grouping of vertebrates arranged in different sub-branches, where animals with high evolutionary proximity were closely grouped in branches, such as: mouse and rat (0.02), and man and chimpanzee (0.01). Nevertheless, evolutionary divergences were also observed in animals with closest evolutionary proximity by clustering zebrafish (0.46), horn shark (0.17) and coelacanth (0.15) in more divergent branches. Thus, structural conservation and phylogenetic proximity described in current study provide insights into the evolutionary history of vertebrates based on phylogenetic relationshipsgenerated from multiple amino acid alignments of the protein HoxA of different animals |
| Resumen en portugués | O objetivo do presente estudo foi investigar as relações filogenéticas entre vertebrados a partir de diferenças na natureza química dos resíduos de aminoácidos da proteína homeótica HoxA por análises comparativas de alinhamentos múltiplos. Após a busca e seleção das sequências da proteína HoxA de 18 animais em um banco de dados de informação biológica, alinhamentos múltiplos de seus resíduos foram efetuados empregando o programa Clustal Omega, seguido pela construção de um dendograma para inferir as relações filogenéticas entre as espécies selecionadas. Análises comparativas dos alinhamentos múltiplos revelaram alta conservação estrutural com valor de identidade máxima de 35,593%entre os aminoácidos da proteína HoxA de distintos vertebrados. Além disso, o dendograma das relações filogenéticas demonstrou o agrupamento dos vertebrados selecionados dispostos em diferentes sub-ramos, onde animais com alta proximidade evolutiva foram intimamente agrupados em alguns sub-ramos, tais como: camundongo e ratazana (0,02) e homem e chimpanzé (0,01). Entretanto, divergências evolutivas em animais com alta proximidade evolutiva também foram observadas com o agrupamento de peixe-zebra (0,46), tubarão chifre (0,17) e celacanto (0,15) em ramos mais divergentes. Assim, conservação estrutural e proximidade filogenética descritas no presente estudo fornecem subsídios acerca da história evolutiva de vertebrados com base nas relações filogenéticas geradas a partir de alinhamentos múltiplos de aminoácidos da proteína HoxA de diferentes animais |
| Disciplines | Biología |
| Paraules clau: | Alineamiento molecular, Evolución genómica, Proteínas, Relaciones filogenéticas, Vertebrados |
| Keyword: | Molecular alignment, Genomic evolution, Phylogenetic relationships, Proteins, Vertebrates |
| Text complet: | https://revistas.ufpr.br/academica/article/view/67589/39744 |
