Cambios genéticos en los genes internos del virus de influenza porcina aislado en México
Título del documento: Cambios genéticos en los genes internos del virus de influenza porcina aislado en México
Revista: Veterinaria México OA
Base de datos: PERIÓDICA
Número de sistema: 000380374
ISSN: 2007-5472
Autors: 1
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1
Institucions: 1Universidad Nacional Autónoma de México, Facultad de Medicina Veterinaria y Zootecnia, México, Distrito Federal. México
2Universidad Nacional Autónoma de México, Facultad de Estudios Superiores Cuautitlán, Cuautitlán, Estado de México. México
3Universidad Nacional Autónoma de México, Instituto de Biotecnología, Cuernavaca, Morelos. México
Any:
Període: Jul-Sep
Volum: 1
Número: 1
País: México
Idioma: Español, inglés
Tipo de documento: Artículo
Enfoque: Aplicado, descriptivo
Resumen en español Hasta el momento, en México sólo se ha publicado un reporte en el que se detallan los cambios genéticos y la divergencia evolutiva en los llamados genes internos de la polimerasa básica 1 (PB1), polimerasa básica 2 (PB2), polimerasa ácida (PA), nucleoproteína (NP), proteína de matriz (M) y la proteína no estructural (NS) del virus de influenza porcina que se extendió durante la pandemia entre 2009 y 2010. El objetivo de este estudio fue evaluar la divergencia evolutiva y los cambios genéticos de las cepas de virus de influenza porcina aisladas en México entre los años 2009-2010. Para caracterizar la historia evolutiva y la relación filogenética entre las cepas de virus aisladas, se utilizó una prueba de probabilidad de máxima verosimilitud usando un bootstrap filogenético con 1000 réplicas. La relación filogenética entre los genes PB1, PB2, PA, NP M y NS corresponde a aislamientos de virus porcinos similares a los consignados en otros países. Sin embargo, el gen PA del virus A/swine/Mexico/Qro35/2010 (H1N1) está estrechamente relacionado a un subtipo viral H3N2 humano. Los genes PB2, NP y M de los virus de influenza porcina mexicanos que proliferaron durante 2009 y 2010, configuran su distribución de acuerdo con los genes internos triplemente recombinantes (TRIG). En nuestro estudio se demuestra la presencia de un gen de PA de un virus humano H3N2 en la cepa de virus porcino A/swine/ Mexico/Qro35/2010 (H1N1)
Resumen en inglés To date, only one report has been published in Mexico detailing the genetic changes and evolutionary divergence in the so-called internal genes basic polymerase-one (PB1), basic polymerase-two (PB2), polymerase acid (PA), nucleoprotein (NP), matrix protein (M), and non-structural protein (NS) of the swine influenza virus that circulated during the 2009 pandemic and in 2010. The aim of this study was to evaluate the evolutionary divergence and genetic changes in these internal genes of the swine influenza virus strains isolated in Mexico in 2009-2010. To characterize the evolutionary history and the phylogenetic relationship among the isolated virus strains, a Maximum Likelihood Model Test analysis and a phylogenetic bootstrap test with 1000 replicates were performed. The phylogenetic relationships among the PB1, PB2, PA, NP, M and NS genes correspond to similar swine virus isolates reported in oth­er countries. However, the PA gene from the A/swine/Mexico/Qro35/2010 (H1N1) virus is closely related to a H3N2-subtype human virus. The PB2, NP, and M genes of the Mexican swine influenza viruses that circulated during 2009 and 2010 maintained the distribution of the Triple Reassortant Internal Genes (TRIG). Significantly, our study demonstrates the presence of a hu­man H3N2 virus PA gene in the A/swine/Mexico/Qro35/2010 (H1N1) virus
Disciplines Medicina veterinaria y zootecnia
Paraules clau: Medicina veterinaria,
Porcinos,
Virus,
Influenza porcina,
Genes internos,
Caracterización filogenética
Keyword: Veterinary medicine and animal husbandry,
Swine,
Veterinary medicine,
Virus,
Swine influenza,
Internal genes,
Phylogenetic characterization
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