Studies of accuracy during protein synthesis involving the E-tRNA and the ShineDalgarno interaction



Título del documento: Studies of accuracy during protein synthesis involving the E-tRNA and the ShineDalgarno interaction
Revista: Salus
Base de datos: PERIÓDICA
Número de sistema: 000342932
ISSN: 1316-7138
Autors: 1
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2
1
Institucions: 1Max Planck Society, Institute for Molecular Genetic, Berlín. Alemania
2Universidad de Carabobo, Instituto Biomedico, Maracay, Aragua. Venezuela
Any:
Volum: 12
Paginació: 73-80
País: Venezuela
Idioma: Inglés
Tipo de documento: Artículo
Enfoque: Analítico
Resumen en español El ribosoma contiene tres sitios de unión para ARNt, los sitios A, P y E. Aunque el sitio E está separado del sitio A por el sitio P, hay una importante comunicación entre ambos. Esta comunicación juega un papel importante en la exactitud de los procesos de decodificación. La interacción codón-anticodón en el sitio E parece ser la señal para cambiar al estado post-translocacional (POST) caracterizado por una baja afinidad del sitio A. Esta baja afinidad determina que los complejos ternarios aminoacil-ARNt•EFTu•GTP solo puedan entrar al sitio A por el centro de decodificación previniendo la selección de aminoacil-ARNts no-complementarios al codón del sitio A y la incorporación de un amino ácido incorrecto. Como consecuencia importante, solo una en 400 incorporaciones erróneas afecta la función de la proteína sintetizada. Otro aspecto de los tres sitios de unión para ARNt es que al menos dos ARNts están presentes en un ribosoma activo. Puesto que durante la elongación los ARNts están fuertemente unidos al ribosoma mientras que el ARNm lo está solo por las interacciones codón-anticodón, el movimiento de los ARNts durante la translocación determina el correspondiente movimiento del ARNm a través del ribosoma. De hecho, los seis pares de bases de las interacciones codón-anticod-on adyascentes son esenciales para el mantenimiento del marco de lectura. Sin la interacción del ARNt-E el marco de lectura probablemente se perdería después de la incorporación de aproximadamente 50 aminoácidos en la cadena polipeptídica naciente
Resumen en inglés The ribosome contains three tRNA binding sites, the A, P and E sites. Although the E site is separated from the A via the intervening P site, there is a striking communication between these sites. This crosstalk plays an important role for the accuracy of the decoding process. Codon-anticodon interaction at the E site seems to be the signal to switch into the post-translocational (POST) state characterized by a low affinity of the A site. This low affinity state forces the ternary complexes aminoacyl-tRNA•EF-Tu•GTP to enter the A site via the decoding center preventing the selection of non-cognate aminoacyl-tRNAs and incorporation of the amino acid. This has the important consequence that only 1 in 400 misincorporations affects protein functions. Another aspect of the three tRNA binding sites is that at least two tRNAs are present on the ribosome. Since the tRNAs are firmly bound by the ribosome whereas the mRNA practically only via codon-anticodon interaction during the elongation phase, the movement of the tRNA during translocation pulls the mRNA through the ribosome. In fact, the six base pairs of two adjacent codon-anticodon interactions are instrumental for maintaining the reading frame. Without the codon-anticodon interaction of the E tRNA the reading frame would be lost at least after the incorporation of about 50 amino acids into the nascent chain
Disciplines Medicina
Paraules clau: Farmacología,
Bioquímica,
Ribosomas,
ARN,
Shine-Dalgarno,
Codones,
Proteínas,
Síntesis
Keyword: Medicine,
Pharmacology,
Biochemistry,
Ribosomes,
RNA,
Shine-Dalgarno,
Codons,
Proteins,
Synthesis
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