Epidemiology of Bean common mosaic virus and Alternaria alternata in 12 Phaseolus vulgaris genotypes
Título del documento: Epidemiology of Bean common mosaic virus and Alternaria alternata in 12 Phaseolus vulgaris genotypes
Revista: Revista mexicana de fitopatología
Base de datos: PERIÓDICA
Número de sistema: 000450779
ISSN: 0185-3309
Autors: 1
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Institucions: 1Colegio de Postgraduados, Texcoco, Estado de México. México
Any:
Volum: 40
Número: 2
Paginació: 188-220
País: México
Idioma: Inglés
Tipo de documento: Artículo
Enfoque: Experimental, analítico
Resumen en español El objetivo de la investigación fue evaluar la respuesta fitosanitaria y comportamiento epidemiológico en 12 genotipos de Phaseolus vulgaris y desarrollar metodologías etiológico-epidemiológicas aplicables a estudios de mejoramiento genético. En ciclo primavera-verano 2020 se realizaron evaluaciones en fases de floración (junio) y fructificación (agosto). La severidad porcentual se evaluó con escala logarítmica-diagramática de 6-clases configurada en App-Monitor® v1.1. La sanidad por genotipo se determinó mediante un Índice de Daño Integrado (IDI), ponderando por intensidad de severidad y corregido por vigor de cobertura-planta (IV), calculado con imágenes (RGB, 14mpx) de dron-Phantom-3 a 5 m altura del centroide de genotipo. Se realizaron pruebas de t-Student (p = 0.05) y ANOVAs, seguido de Tukey (p = 0.05), con SAS v9.4 para las distintas variables experimentales. Se analizó la dependencia espacial de contagio con kriging y variogramas omnidireccionales en SURFER v10. Un total de 43 muestras se emplearon para aislamiento, pruebas de patogenicidad e identificación genómica con iniciadores universales ITS1/ITS4, NIb2F/NIb3R, PBL1v2040/PCR1c para eucariotes, Potyvirus y Begomovirus, respectivamente. La matriz final incluyó 22 variables, 859 observaciones y 18,898 metadatos. En 100% de muestras analizadas se identificó Alternaria alternata y Bean common mosaic virus (BCMV) con 99% de homología. Vaquita Negro, Garrapato y Canario fueron estadísticamente los genotipos más susceptibles (37.3 - 58% severidad) a BCMV, mientras Canario y Tipo Flor de Mayo (41.4 - 42.7%) a A. alternata (p < 0.05). Oti y Negro Perla presentaron mayor adaptabilidad climática y tolerancia a ambos patógenos con IV > 0.7 e IDI < 0.43. Espacialmente, BCMV presentó dispersión aleatoria de focos y efecto de bordo-bloque con contagios continuos de hasta 5.6 metros. Vaquita Negro y Bayo Mecentral tuvieron dispersión viral uniforme, presuntivamente por alta tra
Resumen en inglés Research objective was to assess phytosanitary response and epidemiological behavior in 12 Phaseolus vulgaris genotypes and develop etiological-epidemiological methodologies applicable to plant breeding studies. In 2020 spring-summer season, assessments were conducted at flowering (June) and fructification stages (August). Severity was evaluated with a 6-class logarithmic-diagrammatic scale setup in App-Monitor® v1.1. Genotype health was determined using an Integrated Damage Index (IDI), weighted and adjusted for disease severity and coverage-plant vigor (IV), which was estimated with images (RGB, 14mpx) captured with dron-Phantom-3 at 5 m height from genotype centroid. In SAS v9.4, t-test and ANOVAs, followed by Tukey (p = 0.05), were performed for different experimental settings. Disease spatial patterns were analyzed with kriging and omnidirectional variograms in SURFER v10. Forty-three total samples were used for isolation, pathogenicity testing, and molecular identification with universal primers ITS1/ITS4, NIb2F/NIb3R, PBL1v2040/PCR1c for eukaryotes, Potyvirus and Begomovirus, respectively. Final data matrix included 22 variables, 859 observations and 18,898 metadata. Alternaria alternata and Bean common mosaic virus (BCMV) were identified in 100% of samples analyzed with 99% homology. Vaquita Negro, Garrapato and Canario were statistically the most susceptible genotypes (37.3 - 58% severity) for BCMV, while Canario and Tipo Flor de Mayo (41.4-42.7%) were for A. alternata (p = 0.05). Oti and Negro Perla had higher climatic adaptability and tolerance to both pathogens with IV > 0.7 and IDI < 0.43. Spatially, BCMV presented random dispersion of foci and a block-edge effect with continuous contagion of up to 5.6 meters. Vaquita Negro and Bayo Mecentral showed uniform virus spread, presumptively due to high viral transmissibility by seed. In contrast, except for Tipo Flor de Mayo and Canario, which exhibited significant coalescence of foci, A. altern
Disciplines Agrociencias,
Biología
Paraules clau: Fitopatología,
Leguminosas,
Virus,
Hongos,
Phaseolus vulgaris,
Genotipos,
Alternaria alternata,
Frijol,
Geoestadística,
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Keyword: Phytopathology,
Legumes,
Virus,
Fungi,
Genotypes,
Phaseolus vulgaris,
Bean,
Geostatistics,
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