Microsatélites desarrollados en guayabo (Psidium guajava L.) y su utilidad para evaluar diversidad en la familia Myrtaceae



Título del documento: Microsatélites desarrollados en guayabo (Psidium guajava L.) y su utilidad para evaluar diversidad en la familia Myrtaceae
Revista: Revista colombiana de biotecnología
Base de datos: PERIÓDICA
Número de sistema: 000362781
ISSN: 0123-3475
Autors: 1
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Institucions: 1Instituto de Investigaciones en Fruticultura Tropical, La Habana. Cuba
2Centro de Investigación Científica de Yucatán A.C., Mérida, Yucatán. México
3Centre de Cooperation Internationale en Recherche Agronomique pour le Developpement, Departement des Systemes Agroalimentaires et Ruraux, Montpellier, Herault. Francia
4Max Planck Society, Institute for Plant Breeding Research, Colonia, Nordrhein-Westfalen. Alemania
Any:
Període: Jul
Volum: 12
Número: 1
Paginació: 64-76
País: Colombia
Idioma: Español
Tipo de documento: Artículo
Enfoque: Analítico, descriptivo
Resumen en español La familia Myrtaceae ha evolucionado desde las formas más primitivas en los bosques húmedos y lluviosos hasta formas especializadas en regiones semiáridas, muy secas y altamente influenciadas por los cambios estacionales. Aunque los botánicos han estado describiendo estas especies desde hace 200 años, la clasificación de las mismas no está completamente esclarecida. Las Secuencias Simples Repetidas (SSR), conocidas comúnmente como microsatélites, representan una porción significativa del genoma eucariótico y pueden ser de gran utilidad para estos fines. El objetivo del presente trabajo fue utilizar cebadores SSR, diseñados previamente para guayabo, en la identificación de accesiones y en el estudio de diversidad en Myrtaceae. Para este propósito se emplearon cuatro combinaciones de cebadores SSR siguiendo los protocolos establecidos en la literatura. Se realizó el análisis de los resultados atendiendo a la potencialidad de amplificación cruzada, la detección de diferentes alelos, la utilidad para la identificación de accesiones y el estudio de la diversidad y la determinación de las relaciones existentes entre las especies y cultivares en estudio. El alto nivel de polimorfismo detectado por los microsatélites evaluados, el cual se refleja en los valores de los índices relacionados con el nivel de polimorfismo y la capacidad de discriminación calculados, indica las potencialidades de los SSR para la identificación de accesiones en otros representantes de la familia Myrtaceae. Además, representan una herramienta de gran utilidad para estudios de diversidad en esta familia; así como para la estimación de las relaciones de parentesco entre los genotipos analizados, análisis taxonómico y de filogenia
Resumen en inglés The Myrtaceae family has evolved from primitive forms in rainy and humid forest to specialised forms in semiarid and very dry regions, these being highly influenced by seasonal changes. Although botanists have been describing Myrtaceae family species for more than 200 years, classification is far from being completely clear. Simple sequences repeats (SSR), usually known as microsatellites, represent a significant portion of the eukaryotic genome and can be of great use for these purposes. The object of the present work was to use SSR primers (previously designed in guava) for accession identification and diversity studies on other Myrtaceae family members. Four SSR primer combinations were thus used, following the protocols established in the literature. The results were analysed paying particular attention to cross-amplification potentiality, detecting different alleles, use in accession identification and diversity studies and determining relationships between the species being studied and cultivars. The high level of polymorphism detected by the microsatellites being evaluated (reflected in the values of each index related to polymorphism and calculated discriminating capacity) indicated SSR potential for accession identification in other Myrtaceae family members. It also represents a useful tool for diversity studies in this family and estimating parentage relationships between the genotypes being investigated and taxonomic and phylogenetic analysis
Disciplines Agrociencias
Paraules clau: Frutales,
Genética,
Evolución y filogenia,
Amplificación cruzada,
Identificación de accesiones,
Parentesco
Keyword: Agricultural sciences,
Fruit trees,
Genetics,
Evolution and phylogeny,
Cross amplification,
Accession identification,
Relatedness
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