Miner´ıa de patrones frecuentes para la comprobaci´on de las reglas de Susumu Ohno y su uso en la identificaci´on de evoluci´on de organismos biol´ogicos Resumen
Título del documento: Miner´ıa de patrones frecuentes para la comprobaci´on de las reglas de Susumu Ohno y su uso en la identificaci´on de evoluci´on de organismos biol´ogicos Resumen
Revista: PÄDI boletín científico de ciencias básicas e ingenierías del ICBI
Base de datos:
Número de sistema: 000578185
ISSN: 2007-6363
Autores: 1
1
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Instituciones: 1Universidad Autónoma del Estado de Hidalgo,
Año:
Volumen: 7
Número: 13
Paginación: 84-89
País: México
Idioma: Español
Resumen en inglés Within development of Bioinformatics, pattern mining has becomea critical point of attention. Patterns on Biological sequences,specially repeated patterns, usually shows relevant structuralo functional features. As a result of several studies, SusumuOhno proposed a set of rules that most species should fulfillin order to accomplisg their evolution aspects. The present workvalidates such rules using frequent pattern mining and MarkovChain Techniques assessing 32,074 DNA sequences from diversebiological organisms from GenBank Biological databaseas a part of National Center of Biotechnology Information fromNational Health Institute of the United States. This could identifyorganisms that possess particularities that di ers on theirevolutionWithin development of Bioinformatics, pattern mining has becomea critical point of attention. Patterns on Biological sequences,specially repeated patterns, usually shows relevant structuralo functional features. As a result of several studies, SusumuOhno proposed a set of rules that most species should fulfillin order to accomplisg their evolution aspects. The present workvalidates such rules using frequent pattern mining and MarkovChain Techniques assessing 32,074 DNA sequences from diversebiological organisms from GenBank Biological databaseas a part of National Center of Biotechnology Information fromNational Health Institute of the United States. This could identifyorganisms that possess particularities that di ers on theirevolution
Resumen en español Con el desarrollo de la bioinform´atica, la b´usqueda de patrones frecuentes en secuencias de ADN se ha vuelto un punto deatenci´on cr´ıtico. Los patrones de secuencia biol´ogicos, especialmente patrones que se repiten, usualmente reflejan alguna caracter´ıstica funcional o estructural importante. Como resultado de varios estudios, Susumu Ohno propuso una serie de reglas que lassecuencias de ADN deben cumplir para la propia evoluci´on de esos organismos biol´ogicos. El presente trabajo realiz´o una validaci´on de dichas reglas bas´andose en t´ecnicas de miner´ıa de datos y cadenas de Markov evaluando 32,074 secuencias de ADN dediversos organismos biol´ogicos obtenidos de la base de datos biol´ogica del repositorio GenBank, perteneciente al Centro Nacionalde Informaci´on de Bioinform´atica del departamento de salud de Estados Unidos, y con lo cual se pudo identificar organismos queposeen particularidades que pueden diferenciarlos en su evoluci´on.
Palabras clave: Minería de datos,
Patrones Frecuentes,
Cadenas de Markov,
ADN,
Bioinformática
Keyword: Data mining,
Frequent pattern,
MArkov Chain,
DNA,
Bioinformatics
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