| Revista: | Journal of the Mexican Chemical Society |
| Base de datos: | PERIÓDICA |
| Número de sistema: | 000370697 |
| ISSN: | 1665-9686 |
| Autors: | Medina Franco, José Luis1 Waddell, Jacob1 |
| Institucions: | 1Torrey Pines Institute for Molecular Studies, Port St. Lucie, Florida. Estados Unidos de América |
| Any: | 2012 |
| Període: | Abr-Jun |
| Volum: | 56 |
| Número: | 2 |
| Paginació: | 163-168 |
| País: | México |
| Idioma: | Inglés |
| Tipo de documento: | Artículo |
| Enfoque: | Experimental |
| Resumen en español | Programas de investigación de descubrimiento de fármacos utilizan con mayor frecuencia bases de datos moleculares públicas que contienen información de actividad biológica. Un ejemplo de estas bases de datos es PubChem. En este trabajo se presenta una estrategia para caracterizar en forma sistemática relaciones estructura–actividad biológica en bioensayos disponibles en PubChem utilizando el concepto de panorama de actividad en bioensayos. Esta estrategia es general y puede aplicarse a cualquier grupo de compuestos que se han evaluado en bioensayos diversos. También se presenta una representación visual del espacio químico de una colección de compuestos institucional utilizando una herramienta en línea disponible públicamente |
| Resumen en inglés | Public compound databases annotated with biological activity are increasingly being used in drug discovery programs. A prominent example is of such databases is PubChem. Herein, we introduce an approach to systematically characterize the structure–bioassay activity relationships in PubChem using the concept of bioassay activity landscape. This strategy is general and can be applied to any data set screened across multiple bioassays. We also present a visual representation of the chemical space of an in–house data set using a recently developed web–based public tool |
| Disciplines | Química |
| Paraules clau: | Farmacología, Sistemas de información, Bases de datos, Quimioinformática, Descubrimientos científicos, Fármacos, Biología molecular |
| Keyword: | Chemistry, Pharmacology, Information systems, Databases, Chemoinformatics, Drugs, Scientific discovery, Molecular biology |
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