| Revista: | Journal of the Mexican Chemical Society |
| Base de datos: | PERIÓDICA |
| Número de sistema: | 000367650 |
| ISSN: | 1665-9686 |
| Autors: | Rosales León, Luis1 Hernández Domínguez, Eric Edmundo2 Gaytán Mondragón, Samantha2 Rodríguez Sotres, Rogelio2 |
| Institucions: | 1Universidad Nacional Autónoma de México, Facultad de Medicina, México, Distrito Federal. México 2Universidad Nacional Autónoma de México, Facultad de Química, México, Distrito Federal. México |
| Any: | 2012 |
| Període: | Ene-Mar |
| Volum: | 56 |
| Número: | 1 |
| Paginació: | 23-31 |
| País: | México |
| Idioma: | Inglés |
| Tipo de documento: | Artículo |
| Enfoque: | Experimental, aplicado |
| Resumen en español | En contraste con sus contrapartes bacterianas y animales, la pirofosfatasas inorgánicas solubles de células vegetales son activas como monómeros. La isoformas 1 y 4 de Arabidopsis thaliana se han caracterizado con mayor detalle, pero su estructura tridimensional no está disponible. Aquí, se emplea un protocolo recientemente publicado (ROSETTA design–HMMer), para guiar el modelado por homología en la obtención de modelos confiables de la estructura tridimensional de estas dos proteínas de arabidopsis. Su interacción con iones de magnesio y pirofosfato se analiza in silico |
| Resumen en inglés | In contrast to their counterparts in bacteria and animals the soluble inorganic pyrophosphatases from plant cells are active as monomers. The isoforms 1 and 4 from Arabidopsis thaliana have been characterized with more detail, but their three–dimensional structure is unavailable. Here, a recently published protocol (ROSETTA design–HMMer), is used to guide well–known techniques for homology–modeling, in the production of reliable models for the three–dimensional structure of these two arabidopsis isoforms. Their interaction with magnesium ions and pyrophosphate is analyzed in silico |
| Disciplines | Química |
| Paraules clau: | Bioquímica, Pirofosfatasas, Células vegetales, Estereoquímica, Estructura tridimensional, Proteínas |
| Keyword: | Chemistry, Biochemistry, Pyrophosphatase, Plant cells, Stereochemistry, Three-dimensional structures, Proteins |
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