| Revista: | Journal of the Mexican Chemical Society |
| Base de datos: | PERIÓDICA |
| Número de sistema: | 000370403 |
| ISSN: | 1665-9686 |
| Autors: | Ivey, Kirsten1 Sanders, Belynda1 Chris, Estela1 Cooksy, Andrew L1 |
| Institucions: | 1San Diego State University, Department of Chemistry and Biochemistry, San Diego, California. Estados Unidos de América |
| Any: | 2011 |
| Període: | Ene-Mar |
| Volum: | 55 |
| Número: | 1 |
| Paginació: | 11-15 |
| País: | México |
| Idioma: | Inglés |
| Tipo de documento: | Artículo |
| Enfoque: | Experimental |
| Resumen en español | Se investigaron las reacciones tempranas en el metabolismo de la metilamina por el cofactor quinon-triptofil-triptofano (TTQ), mediante una larga serie de cálculos de la teoría de funcionales de la densidad. Las correcciones a las energías libres se calcularon en las geometrías del reactivo y de los intermediarios, así como los efectos del disolvente se estimaron por el modelo semi-empírico COSMO-RS. Se encontró que dos caminos de reacción compiten, teniendo energías libres de reacción muy similares, y las energías libres de activación dependen mucho de un modelado adecuado del disolvente |
| Resumen en inglés | The reaction sequence early in the metabolism of methylamine by the dehydrogenase cofactor tryptophan tryptophyl quinone (TTQ) is investigated by a large series of density functional theory calculations. Free energy corrections are calculated at the reactant and intermediate geometries, and solvation effects are estimated by use of the semi-empirical COSMO-RS solvent model. Two competing reaction paths are found to have very similar reaction free energies, and the free energies of activation are found to depend heavily on adequate modeling of the solvent |
| Disciplines | Ciencias de la computación, Química |
| Paraules clau: | Bioquímica, Fisicoquímica y química teórica, Computación, Quinon triptofil triptofano (TTQ), Teoría del funcional de la densidad (DFT), COSMO-RS, Modelo del disolvente |
| Keyword: | Computer science, Chemistry, Biochemistry, Physical and theoretical chemistry, Computing, Tryptophan tryptophyl quinone (TTQ), Density functional theory (DFT), COSMO-RS, Solvent model |
| Text complet: | Texto completo (Ver PDF) |
