| Revista: | Journal of science and research |
| Base de datos: | CLASE |
| Número de sistema: | 000463234 |
| ISSN: | 2528-8083 |
| Autors: | Sharafi, Ata Allah1 Abkenar, Asad Asadi2 Sharafi, Ali3 |
| Institucions: | 1University of Guilan, Rasht, Guilán. Irán 2Agricultural Biotechnology Research Institute of Iran, Rasht, Guilán. Irán 3Zanjan University of Medical Sciences, School of Pharmacy, Zanyán. Irán |
| Any: | 2017 |
| Període: | Oct-Dic |
| Volum: | 2 |
| Número: | 8 |
| Paginació: | 22-27 |
| País: | Ecuador |
| Idioma: | Inglés |
| Tipo de documento: | Nota breve o noticia |
| Enfoque: | Analítico |
| Resumen en español | En este estudio, se analizó la diversidad genética en 19 cultivares de cítricos mediante la repetición de secuencia simple (SSR), la repetición de secuencia inter-simple (ISSR) y los marcadores de secuencia polimórfica amplificada segmentada (CAPS). Se utilizaron nueve cebadores para SSR, nueve cebadores ISSR y dos cebadores para CAPS para la puntuación del alelo. Se analizaron una región de ADN de cloroplasto (rbcL-ORF106) y una región de ADN mitocondrial (18S-5S) usando marcador de secuencia polimórfica amplificada escindida (CAPS) en 19 accesiones de cítricos cultivadas en Irán. En total, se detectaron 45 genes SSR y 131 ISSR polimórficos alelos y organelos del genoma del árbol. El análisis de conglomerados de los datos SSR y ISSR se realizó utilizando el método UPGMA y se basó en el coeficiente de Jaccard. El resultado de esta investigación mostró que los cebadores SSR e ISSR eran altamente informativos y eficientes para detectar la variabilidad genética y las relaciones de las accesiones de los cítricos. Y el análisis de marcadores de CAPS Los resultados mostraron que Bakraee y uno de tipo off cal mexicana tenían un patrón de bandas similar al Clementine Mandarin, mientras que Pummelo se consideraba como padre materno de otros genotipos estudiados Citron considerado como padre padre mostró un patrón de bandas definido entre 19 genotipos estudiados que confirmó Citoplasma herencia de orgánulos celulares de la madre |
| Resumen en inglés | In this study, genetic diversity in 19 citrus cultivars was analyzed using Simple Sequence Repeat (SSR), Inter-simpleSequence Repeat (ISSR) and cleaved amplified polymorphic sequence (CAPS) markers. Nine primers for SSR, nine ISSR primersand two primers for CAPS were used for allele scoring. One chloroplast DNA region (rbcL-ORF106) and one mitochondrial DNAregion (18S-5S) were analyzed using cleaved amplified polymorphic sequence (CAPS) marker in 19 citrus accessions grown in Iran.In total, 45 SSR and 131 ISSR polymorphic alleles and tree organelle genome types were detected. Cluster analysis of SSR and ISSRdata was performed using UPGMA method and based on Jaccard’s coefficient. The result of this investigation showed that the SSRand ISSR primers were highly informative and efficient in detecting genetic variability and relationships of the citrus accessions.CAPS marker analysis results showed that Bakraee and one of off type Mexican lime had banding pattern similar to ClementineMandarin, while Pummelo regarded as maternal parent of other studied genotypes Citron regarded as father parent showed definitebanding pattern among 19 studied genotypes which it confirmed Cytoplasmic inheritance from mother cellular organelles |
| Disciplines | Biología, Agrociencias |
| Paraules clau: | Genética, Frutales, Cítricos, Diversidad genética, Marcadores moleculares, Variedades, Genotipos, Irán |
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