| Revista: | Hidrobiológica (México, D.F.) |
| Base de datos: | PERIÓDICA |
| Número de sistema: | 000425628 |
| ISSN: | 0188-8897 |
| Autors: | Bisbal Pardo, Celia Isabel1 Del Río Portilla, Miguel Ángel2 Castillo Páez, Ana1 Rocha Olivares, Axayácatl1 |
| Institucions: | 1Centro de Investigación Científica y de Educación Superior de Ensenada, Departamento de Oceanografía Biológica, Ensenada, Baja California. México 2Centro de Investigación Científica y de Educación Superior de Ensenada, Departamento de Acuicultura, Ensenada, Baja California. México |
| Any: | 2018 |
| Període: | Ene-Abr |
| Volum: | 28 |
| Número: | 1 |
| País: | México |
| Idioma: | Inglés |
| Tipo de documento: | Artículo |
| Enfoque: | Aplicado, descriptivo |
| Resumen en español | Antecedentes Panopea generosa es una almeja de gran tamaño, infáunica y longeva con un valor comercial considerable en Canadá, Estados Unidos y México, y de la que se requiere conocer su estructura genética poblacional a lo largo de su rango de distribución. Objetivos Desarrollar nuevos marcadores microsatélites específicos para P. generosa. Métodos En este reporte evaluamos 30 loci microsatélites generados mediante secuenciación genómica de siguiente generación (Illumina Hi-Seq 2500). Resultados Se identificaron a ocho como marcadores genéticos polimórficos adecuados. El número de alelos por locus varió entre 5 y 22, la heterocigosidad observada entre 0.429 y 0.818 y la esperada entre 0.548 y 0.962. Tres marcadores se desviaron del equilibrio de Hardy-Weinberg, después de la corrección de Dunn-Šidák, como resultado de un déficit de heterocigosidad, sugiriendo la presencia de alelos nulos y se encontró desequilibrio de ligamiento entre dos microsatélites. Conclusiones Estos marcadores son altamente informativos y útiles para estudios de genética poblacional encaminados a la implementación de medidas de administración y conservación de este valioso recurso |
| Resumen en inglés | Background Panopea generosa is a large and long-lived infaunal clam with a considerable commercial value in Canada, United States and Mexico, in need of population genetic studies across its range of distribution. Goals We set to develop new genetic markers (microsatellites) specific for P. generosa. Methods We tested 30 microsatellite loci generated using next-generation genome sequencing (Illumina Hi-Seq 2500). Results We identified eight as suitable polymorphic genetic markers. The number of alleles per locus ranged from 5 to 22 and heterozygosity from 0.429 to 0.818 (observed) and from 0.548 to 0.962 (expected). Deviation from Hardy-Weinberg equilibrium was found in three loci, after Dunn-Šidák correction, as a result of heterozygote deficiencies suggesting the presence of null alleles and linkage disequilibrium was found between two loci. Conclusions These markers are highly informative and useful for population genetic studies aimed at informing management and conservation measures of this valuable resource |
| Disciplines | Biología |
| Paraules clau: | Moluscos, Genética, Secuenciación de próxima generación, Marcadores genéticos, Microsatélites, Panopea generosa, Bivalvia |
| Keyword: | Molluscs, Genetics, Next generation sequencing, Genetic markers, Microsatellites, Panopea generosa, Bivalvia |
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