RAPD optimization for genetic studies with Citrullus lanatus and Sesamum indicum genotypes



Título del documento: RAPD optimization for genetic studies with Citrullus lanatus and Sesamum indicum genotypes
Revista: CBAB. Crop breeding and applied biotechnology
Base de datos: PERIÓDICA
Número de sistema: 000269181
ISSN: 1518-7853
Autors: 1
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Institucions: 1Universidade Estadual Paulista "Julio de Mesquita Filho", Faculdade de Ciencias Agrarias e Veterinarias, Jaboticabal, Sao Paulo. Brasil
2Universidade Estadual Paulista "Julio de Mesquita Filho", Departamento de Tecnologia, Jaboticabal, Sao Paulo. Brasil
3Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuaria, Algodao, Campina Grande, Paraiba. Brasil
4Agencia Paulista de Tecnologia dos Agronegocios, Ribeirao Preto, Sao Paulo. Brasil
Any:
Període: Jun
Volum: 6
Número: 2
Paginació: 167-170
País: Brasil
Idioma: Inglés
Tipo de documento: Artículo
Enfoque: Experimental
Resumen en inglés The Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) technique is powerful for DNA polymorphism determinations and is widely used in research involving different organisms, but it is known that RAPD can be affected by many factors that may result in false positive bands and non-reproducible assays. In this study, we analyzed the effect of several factors such as DNA template, primer and Taq DNA polymerase concentrations to optimize and standardize the RAPD technique for further genetic studies with Citrulus lanattus and Sesamum indicum L. The best combination of DNA, Taq DNA polymerase enzyme and primer concentrations in RAPD amplification procedures for sesame and watermelon genotypes was established
Resumen en portugués Apesar do polimorfismo de DNA amplificado ao acaso (RAPD) ser uma técnica poderosa na determinação do polimorfismo do DNA e ser empregado por pesquisadores em muitos estudos relacionados com diferentes organismos, sabe-se que o RAPD é afetado por muitos fatores que podem resultar na presença de bandas falsas, causando a falta de reproducibilidade dos experimentos. Nesse estudo foram analisados os efeitos de diferentes fatores como as concentrações de DNA, dos iniciadores e da Taq DNA polimerase, objetivando otimizar e padronizar a técnica RAPD para os estudos genéticos com Citrulus lanattus e Sesamum indicum. A melhor combinação dos parâmetros analisados como concentração de DNA, iniciadores e da enzima Taq polimerase para uso em reações de RAPD com as culturas gergelim e melancia é fornecida
Disciplines Agrociencias
Paraules clau: Biotecnología,
Genética,
Mejoramiento genético,
Citrullus lanatus,
Sesamum indicum,
RAPD,
ADN,
Sandía,
Ajonjolí,
Genotipos
Keyword: Agricultural sciences,
Genetic improvement,
Citrullus lanatus,
Sesamum indicum,
RAPD,
DNA,
Watermelon,
Sesame,
Genotypes,
Genetics
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