Comparison of DNA-extraction methods and selective enrichment broths on the detection of Salmonella typhimurium in swine feces by polymerase chain reaction (PCR)



Título del documento: Comparison of DNA-extraction methods and selective enrichment broths on the detection of Salmonella typhimurium in swine feces by polymerase chain reaction (PCR)
Revista: Brazilian journal of microbiology
Base de datos: PERIÓDICA
Número de sistema: 000291158
ISSN: 1517-8382
Autors: 1

Institucions: 1Universidade Estadual Paulista "Julio de Mesquita Filho", Faculdade de Ciencias Agrarias e Veterinarias, Sao Paulo. Brasil
Any:
Període: Oct-Dic
Volum: 36
Número: 4
Paginació: 363-367
País: Brasil
Idioma: Inglés
Tipo de documento: Artículo
Enfoque: Experimental
Resumen en inglés The aim of this study was to compare different DNA-extraction methods and selective enrichment broths for their effectiveness to detect Salmonella typhimurium in artificially inoculated swine feces samples (100 CFU/g) by polymerase chain reaction. After enrichment in Rappaport-Vassiliadis, selenite cystine or Müller-Kauffmann tetrathionate, aliquots were used for DNA extraction by three different methods: boiling-centrifugation, phenol-chloroform and salting-out. Aliquots of extracted DNA were then used as template in PCR. The selective enrichment broths had no effect on the efficiency of PCR when boiling-centrifugation and salting-out were used. On the other hand, phenol-chloroform was superior (P<0.05) when combined to Rappaport-Vassiliadis. Considering cost and efficiency parameters, we encourage the use of Müller-Kauffmann tetrathionate broth in combination with boiling-centrifugation DNA-extraction procedure
Resumen en portugués O objetivo do presente estudo foi comparar diferentes técnicas de extração de DNA, realizadas a partir de três diferentes caldos de enriquecimento seletivo, na sua eficiência em detectar Salmonella Typhimurium em amostras de fezes suínas artificialmente inoculadas (100 UFC/g), pela técnica de reação em cadeia da polimerase (PCR). Após enriquecimento em Rappaport-Vassiliadis, selenito-cistina e tetrationato Müller-Kauffmann, alíquotas destes caldos foram utilizadas para extração do DNA, empregando três métodos diferentes, (a) fervura-centrifugação, (b) fenol-clorofórmio e (c) precipitação por sal. A eficiência dos métodos de extração de DNA por fervura-centrifugação e precipitação por sal foi a mesma, independentemente do caldo de enriquecimento seletivo utilizado. O caldo Rappaport-Vassiliadis apresentou maior eficiência (P<0,05) quando foi empregada a extração de DNA pelo método fenol-clorofórmio. Considerados os parâmetros custo e eficiência, os resultados do estudo indicaram que a partir de amostras fecais suínas a utilização do caldo tetrationato Müller-Kauffmann combinado a técnica de extração do DNA por fervura-centrifugação devam representar a melhor opção, relativamente às demais técnicas testadas
Disciplines Medicina veterinaria y zootecnia
Paraules clau: Porcinos,
Parasitología,
ADN,
Salmonella typhimurium,
PCR,
Diagnóstico,
Heces
Keyword: Veterinary medicine and animal husbandry,
Swine,
Parasitology,
Salmonella typhimurium,
Diagnosis,
DNA,
Feces,
PCR
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