| Revista: | Brazilian journal of microbiology |
| Base de datos: | PERIÓDICA |
| Número de sistema: | 000291258 |
| ISSN: | 1517-8382 |
| Autors: | Chies, Jocelei M1 Dias, Ana C. de O Maia, Helio M.M2 Astolfi-Filho, Spartaco3 |
| Institucions: | 1Universidade Federal do Rio Grande do Sul, Centro de Biotecnologia, Rio Grande, Rio Grande do Sul. Brasil 2Universidade Federal do Amazonas, Centro de Apoio Multidisciplinar, Manaus, Amazonas. Brasil 3Universidade de Brasilia, Pos-Graduacao em Biologia Molecular, Brasilia, Distrito Federal. Brasil |
| Any: | 2006 |
| Període: | Ene-Mar |
| Volum: | 37 |
| Número: | 1 |
| Paginació: | 96-100 |
| País: | Brasil |
| Idioma: | Inglés |
| Tipo de documento: | Artículo |
| Enfoque: | Experimental |
| Resumen en inglés | A strain of Bacillus pumilus was isolated and identified from water samples collected from a small affluent of the Amazon River. Type II restriction endonuclease activity was detected in these bacteria. The enzyme was purified and the molecular weight of the native protein estimated by gel filtration and SDS-PAGE. The optimum pH, temperature and salt requirements were determined. Quality control assays showed the complete absence of "nonspecific nucleases." Restriction cleavage analysis and DNA sequencing of restriction fragments allowed the unequivocal demonstration of 5´GAG¯CTC3´ as the recognition sequence. This enzyme was named BpuAmI and is apparently a neoschizomer of the prototype restriction endonuclease SacI. This is the first report of an isoschizomer and/or neoschizomer of the prototype SacI identified in the genus Bacillus |
| Resumen en portugués | Uma linhagem de Bacillus pumilus foi isolada e identificada de amostras de águas coletadas em um pequeno Igarapé do Rio Amazonas. Foi detectada atividade de restrição do tipo II nesta bactéria. A enzima foi purificada e o peso molecular da proteína nativa foi estimado por gel filtração e por eletroforese em gel de poliacrilamida. Foram determinados, o pH e temperatura ótimos e as necessidades de sais. Os ensaios do controle de qualidade mostraram uma ausência completa de "nucleases não específicas". As analises das clivagens e o seqüenciamento do DNA dos fragmentos de restrição permitiram uma demonstração inequívoca de que 5´GAG¯CTC 3´ é a seqüência de reconhecimento da enzima. Esta enzima foi denominada de BpuAmI e aparentemente é um neoesquisômero da enzima protótipo SacI. Este é o primeiro relato de um isoesquisômero e/ou neoesquisômero da enzima protótipo SacI identificada no gênero Bacillus |
| Disciplines | Química, Biología |
| Paraules clau: | Bioquímica, Bacterias, Genética, Endonucleasa de restricción tipo II, BpuAmI, SacI, Neoesquizomeros, Bacillus pumilus |
| Keyword: | Chemistry, Biology, Biochemistry, Bacteria, Genetics, Type II restriction endonuclease, BpuAmI, SacI, Neoschizomers |
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