| Revista: | Brazilian archives of biology and technology |
| Base de datos: | PERIÓDICA |
| Número de sistema: | 000331600 |
| ISSN: | 1516-8913 |
| Autors: | Bitencourt, Joao Vitor Trindade1 Roratto, Paula Angelica1 Bartholomei-Santos, Marlise Ladvocat1 Santos, Sandro1 |
| Institucions: | 1Universidade Federal de Santa Maria, Centro de Ciencias Naturais e Exatas, Santa Maria, Rio Grande do Sul. Brasil |
| Any: | 2007 |
| Període: | Nov |
| Volum: | 50 |
| Número: | 6 |
| Paginació: | 989-994 |
| País: | Brasil |
| Idioma: | Inglés |
| Tipo de documento: | Artículo |
| Enfoque: | Analítico, descriptivo |
| Resumen en inglés | The aim of this study was to compare some DNA extraction methodologies for Aegla longirostri. The protocols were based on the traditional phenol-chloroform DNA extraction methodology and using a commercial kit for DNA extraction. They differed in tissues used, the addition – or not – of b-mercaptoethanol to the lysis buffer, times and methods for the animal's conservation (frozen, in ethanol or fresh). Individuals stored at –20°C for a long time supplied lower molecular weight DNA than those stored for a short time. The best yield for the specimens preserved in ethanol was obtained for 15 days storage in 95% ethanol. The kit resulted in a low quantity of high molecular weight DNA. The best protocol for DNA extraction from Aeglidae, and probably for other crustaceans should, therefore, utilize fresh specimens, with addition of b-mercaptoethanol to the lysis buffer |
| Resumen en portugués | Marcadores moleculares são ferramentas úteis para esclarecer dúvidas a respeito dos Aeglidae, único grupo de crustáceos Anomura de água doce. Essas técnicas dependem da obtenção de DNA de boa qualidade e sem contaminantes. O objetivo deste estudo foi comparar algumas metodologias de extração de DNA de Aegla longirostri. Quatorze protocolos foram analisados, baseados na metodologia tradicional de extração de DNA com fenol-clorofórmio, exceto o protocolo K no qual se utilizou um Kit. Os procedimentos diferiram quanto aos tecidos utilizados e a adição de b-mercaptoetanol ao tampão de lise. Avaliaram-se também diferentes tempos e maneiras de conservação. Indivíduos congelados apresentaram maior degradação do material obtido conforme o tempo em que ficaram congelados. Para os indivíduos conservados em álcool, aqueles mantidos em etanol 95% forneceram material de melhor qualidade. A utilização do Mini Kit resultou em uma quantidade muito pequena de DNA de alto peso molecular. O melhor protocolo para extração de DNA de Aeglidae utilizou músculos e brânquias, de indivíduos frescos com adição de b-mercaptoetanol ao tampão de lise |
| Disciplines | Biología, Química |
| Paraules clau: | Crustáceos, Genética, Zoología, Bioquímica, Anomura, Aeglidae, Aegla longirostri, Cangrejos dulceacuícolas, Extracción de ADN, Marcadores moleculares |
| Keyword: | Biology, Chemistry, Crustaceans, Genetics, Zoology, Biochemistry, Anomura, Aeglidae, Aegla longirostri, Freshwater crabs, DNA extraction, Molecular markers |
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