| Revista: | Brazilian archives of biology and technology |
| Base de datos: | PERIÓDICA |
| Número de sistema: | 000331218 |
| ISSN: | 1516-8913 |
| Autors: | Souza, Silvia Graciele Hulse de1 Carpentieri-Pipolo, Valeria1 Ruas, Claudete de Fatima2 Carvalho, Valdemar de Paula3 Ruas, Paulo Mauricio2 Gerage, Antonio Carlos4 |
| Institucions: | 1Universidade Estadual de Londrina, Departamento de Agronomia, Londrina, Parana. Brasil 2Universidade Estadual de Londrina, Departamento de Biologia, Londrina, Parana. Brasil 3Universidade Estadual de Goias, Departamento de Biologia, Anapolis, Goias. Brasil 4Instituto Agronomico do Parana, Londrina, Parana. Brasil |
| Any: | 2008 |
| Període: | Ene-Feb |
| Volum: | 51 |
| Número: | 1 |
| Paginació: | 183-192 |
| País: | Brasil |
| Idioma: | Inglés |
| Tipo de documento: | Artículo |
| Enfoque: | Experimental, aplicado |
| Resumen en inglés | The RAPD and SSR markers were used to compare the genetic diversity among the 16 maize inbred lines. Twenty-two primers were used in the RAPD reactions, resulting in the amplification of 265 fragments, while 16 pairs of SSR primers resulted in 75 fragments. The similarity based on Dice coefficient for the RAPD ranged from 53 to 84% and for the SSR from 11 to 82%. The dendrogram obtained by the RAPD showed five groups, while dendrogram obtained by the SSR showed three groups and one isolated line. The association constructed from the markers and the principal coordinates analysis separated lines into two groups according to endosperm color, either orange or yellow. The RAPD were effective to validate pedigree data, while the SSR were effective to recognize the differences between the quantitative characters. Because they assess the distinct regions of the genome, the selection of one or other marker would depend on the characteristics of the material used and the objectives of the project |
| Resumen en portugués | RAPD e SSR foram utlizados para comparar a diversidade genética entre 16 linhagens de milho. Nas reações de RAPD foram utlizados 22 primers que resultaram na amplificação de 265 fragmentos, enquanto que 16 pares de primes de SSR resultaram em 75 fragmentos. A similaridade baseada no coeficiente de Dice variou de 53% a 84% para o RAPD; para o SSR variou de 11% a 82%. O dendrograma obtido a partir do RAPD mostrou 5 grupos enquanto que o dendrograma obtido a partir do SSR mostrou 3 grupos e uma linhagem isolada. A associação construída a partir dos marcadores e a análise de coordenadas principais separaram as linhagens em dois grupos de acordo coloração de endosperma alaranjado ou amarelo, os marcadores RAPD foram eficientes para a validação dos dados de pedigree enquanto os de microssatélites para reconhecerem diferenças entre caracteres quantitativos. Por acessarem regiões distintas do genoma a escolha de um ou outro marcador vai depender das características do material utilizado e dos objetivos do trabalho |
| Disciplines | Biología, Agrociencias |
| Paraules clau: | Genética, Gramíneas, Marcadores moleculares, Polimorfismo genético, Microsatélites, Diversidad genética, RAPD, Maíz, Zea mays |
| Keyword: | Biology, Agricultural sciences, Genetics, Gramineae, Molecular markers, Genetic polymorphism, Microsatellites, Genetic diversity, RAPD, Corn, Zea mays |
| Text complet: | Texto completo (Ver HTML) |
