| Revista: | Botanical Sciences |
| Base de datos: | PERIÓDICA |
| Número de sistema: | 000421958 |
| ISSN: | 2007-4298 |
| Autors: | Villanueva Viramontes, Sara1 Hernández Apolinar, Mariana2 Carnevali Fernández Concha, Germán1 Dorantes Euán, Alfredo1 Dzib, Gabriel R1 Martínez Castillo, Jaime1 |
| Institucions: | 1Centro de Investigación Científica de Yucatán A.C., Mérida, Yucatán. México 2Universidad Nacional Autónoma de México, Facultad de Ciencias, Ciudad de México. México |
| Any: | 2017 |
| Període: | Abr-Jun |
| Volum: | 95 |
| Número: | 2 |
| País: | México |
| Idioma: | Inglés |
| Tipo de documento: | Artículo |
| Enfoque: | Analítico, descriptivo |
| Resumen en español | Antecedentes: Vanilla planifolia es una especie amenazada que se distribuye naturalmente en las selvas tropicales perennifolias y subperennifolias del sureste de México y parte de Centroamérica. En estado silvestre, es difícil de diferenciar de otras especies simpátricas de Vanilla, y usualmente se requieren individuos con estructuras reproductivas. Preguntas: ¿Pueden los marcadores ISSR discriminar individuos silvestres de Vanilla planifolia de otras especies simpátricas de vainilla?, ¿Puede el análisis de ITS recobrar la monofilia de V. planifolia y contribuir a identificar las especies de Vanilla? Especie en estudio: Económicamente, la vainilla (Vanilla planifolia) es la segunda especia más importante en el mundo. Sitio de estudio y fecha: La colecta se realizó en 2014 en la Península de Yucatán. Métodos: Se analizaron 88 de individuos silvestres de especies de Vanilla. Se utilizaron como testigos individuos de cinco especies de vainilla reportadas para la región. 84 loci de ISSR fueron analizados usando tres métodos de agrupamiento. Se realizó una inferencia filogenética con ITS. Resultados: Los ISSR discriminaron claramente a los individuos silvestres de Vanilla planifolia, detectando una estructura genética al interior de la especie. Los tres métodos de agrupamiento mostraron patrones congruentes, encontrándose cinco grupos que correspondieron con las especies estudiadas. El análisis filogenético de las secuencias de ITS mostró la monofilia del género Vanilla, y los cladogramas obtenidos fueron coherentes con los resultados obtenidos con los ISSR. Conclusiones: Tanto ISSR como ITS identificaron a Vanilla planifolia. Los análisis moleculares sugieren la presencia de V. pompona y de una nueva especie de Vanilla en la Península de Yucatán, México |
| Resumen en inglés | Background: Vanilla planifolia, a threatened species, is distributed naturally in semi-deciduous and evergreen rain forests of southeastern Mexico and parts of Central America. In the wild, it is difficult to diagnose from another sympatric Vanilla species, and individuals with reproductive structures are usually required. Questions: Can ISSR discriminate wild individuals of Vanilla planifolia from other sympatric species of the genus? Can phylogenetic analyses of ITS recover the monophyly of V. planifolia and help identify Vanilla species? Studied species: The vanilla (V. planifolia), the second-most important economically spice in the world. Study site and years of study: Plant material was collected during 2014 in the Mexican Yucatan Peninsula. Methods: We analyzed 88 wild individuals of several Vanilla species. Individuals of five species of Vanilla reported for the region were used as reference. 84 ISSR loci were analyzed using three clustering methods. A phylogenetic inference using ITS was performed. Results: ISSR markers clearly discriminate wild Vanilla planifolia, finding definite genetic structure within the species. The three clustering methods identified genetic relationships with congruent patterns. Five groups were found and they corresponded with the species studied. Phylogenetic inference of ITS sequences supported the monophyly of the Vanilla and the resulting cladograms were coherent with the clustering pattern observed in the ISSR studies. Conclusions: Both ISSR and ITS analyses are able to identify V. planifolia. Molecular data suggest the presence of V. pompona and a new species of Vanilla in the Yucatan Peninsula |
| Disciplines | Biología |
| Paraules clau: | Evolución y filogenia, Genética, Ecología, Análisis filogenético, Identificación genética, Marcadores moleculares, Poblaciones silvestres, Vainilla |
| Keyword: | Evolution and phylogeny, Genetics, Ecology, Genetic identification, Molecular markers, Phylogenetic analysis, Vanilla, Wild populations |
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