Evaluation of genetic diversity in Alcea (Malvaceae) using SRAP markers



Título del documento: Evaluation of genetic diversity in Alcea (Malvaceae) using SRAP markers
Revista: Botanical sciences
Base de datos: PERIÓDICA
Número de sistema: 000380645
ISSN: 2007-4298
Autors: 1
1
2
Institucions: 1Urmia University, Department of Biology and Biotechnology Research Center, Urmia, Azerbaiyán. Irán
2Agriculture and Natural Resources Research Center, Urmia, Azerbaiyán. Irán
Any:
Període: Sep
Volum: 92
Número: 3
Paginació: 433-439
País: México
Idioma: Inglés
Tipo de documento: Artículo
Enfoque: Experimental, analítico
Resumen en español En este trabajo se usó el marcador de polimorfismo de amplificado de secuencias relacionadas (SRAP) para evaluar la diversidad genética y las relaciones de similitud genética en 14 especies de Alcea distribuidas en el noroeste de Irán. La combinación de 17 primers de SRAP generaron 104 fragmentos, de los cuales 97 (93%) fueron polimórficos, con un promedio de 5.7 fragmentos polimórficos por primer. El promedio de polimorfismos varió entre 50% (ME2-EM6) y 100%, y el contenido de información de polimorfismo fue de 0.3. Las semejanzas genéticas más bajas (0.17) se observaron entre A. sophiae y A. flavovirens mientras la más alta se encontró entre A. digitata y A. longipedicellata (0.68). Usando UPGMA se encontraron dos grupos principales sin relación al origen geográfico de las especies. El estudio indica que el marcador SRAP podría ser un buen candidato para evaluar la variación genética en Alcea
Resumen en inglés In this work, sequence-related amplified polymorphism (SRAP) marker was employed to assess the genetic diversity and genetic similarity relationships among14 species of Alcea collected from northwest of Iran. Seventeen SRAP primer combinations generated 104 fragments, of which 97 (93%) were polymorphic, with an average of 5.7 polymorphic fragments per primer. Percentage of polymorphism ranged from 50% (ME2-EM6) to a maximum of 100%, and mean polymorphism information content value obtained was 0.3. The lowest genetic similarity (0.17) was observed between A. sophiae and A. flavovirens, while the highest was found between A. digitata and A. longipedicellata (0.68). Two main clusters were detected using UPGMA, which did not correspond to geographical origin of the species. The study indicates that SRAP markers could be good candidates for assessing genetic variation in Alcea
Disciplines Biología
Paraules clau: Angiospermas,
Evolución y filogenia,
Alcea,
Malvaceae,
Diversidad genética,
Marcadores moleculares,
Polimorfismo
Keyword: Biology,
Angiosperms,
Evolution and phylogeny,
Alcea,
Malvaceae,
Genetic diversity,
Molecular markers,
Polymorphism
Text complet: Texto completo (Ver HTML)