Bioinformatic tools for proteomic data analysis: an overview



Título del documento: Bioinformatic tools for proteomic data analysis: an overview
Revista: Biotecnología aplicada
Base de datos: PERIÓDICA
Número de sistema: 000322804
ISSN: 0864-4551
Autors: 1
1
Institucions: 1Centro de Ingeniería Genética y Biotecnología, División de Fisicoquímica, La Habana. Cuba
Any:
Volum: 25
Número: 4
Paginació: 312-319
País: Cuba
Idioma: Inglés
Tipo de documento: Artículo
Enfoque: Experimental, aplicado
Resumen en español La posibilidad de identificar todos los genes o proteínas expresados en un determinado estado celular ha incrementado considerablemente la cantidad de datos disponibles. Por tanto, la bioinformática se ha convertido en un puente que media entre los datos experimentales y las tareas computacionales de gestión, minería y recuperación de información. En este artículo se mencionan algunas bases de datos y programas bioinformáticos que se utilizan en la interpretación biológica de los datos obtenidos en experimentos de proteómica. Acerca de estas herramientas se describen sus principales funcionalidades y limitaciones. Los retos actuales del análisis de datos están relacionados principalmente con la integración de información biológica a partir de diferentes fuentes. En este sentido, deben desarrollarse nuevas bases de datos y programas, que en su conjunto contribuyan a lograr las oportunidades potenciales que ofrece la proteómica
Resumen en inglés Over the years the identification of one gene or protein has been substituted by the determination, in a single experiment, of all the genes or proteins expressed in a given cellular state. Consequently, the amount of available data has increased considerably. In this scenario, bioinformatics has become the bridge between experimental data and computational tasks for managing, mining and retrieving information. The current paper provides an overview on the bioinformatic databases and software used to analyze the biological meaning of proteomic data, thus describing the main functions and limitations of these tools. The important challenges of data analysis are mainly related to the integration of biological information from dissimilar sources. In this field, the improvement in databases and developments in software in the future would contribute to the potential opportunities given by proteomics
Disciplines Bibliotecología y ciencia de la información
Paraules clau: Tecnología de la información,
Biotecnología,
Proteómica,
Bases de datos,
Minería de datos,
Bioinformática
Keyword: Library and information science,
Information technology,
Proteomics,
Databases,
Data mining,
Bioinformatics
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