Análisis de datos de microarreglos de ADN. Parte II: Cuantificación y análisis de la expresión génica Jamilet Miranda , Ricardo Bringas



Título del documento: Análisis de datos de microarreglos de ADN. Parte II: Cuantificación y análisis de la expresión génica Jamilet Miranda , Ricardo Bringas
Revista: Biotecnología aplicada
Base de datos: PERIÓDICA
Número de sistema: 000322803
ISSN: 0864-4551
Autores: 1
1
Instituciones: 1Centro de Ingeniería Genética y Biotecnología, La Habana. Cuba
Año:
Volumen: 25
Número: 4
Paginación: 290-300
País: Cuba
Idioma: Español
Tipo de documento: Artículo
Enfoque: Experimental, aplicado
Resumen en español Los experimentos de microarreglos de ADN constan de una primera etapa, en la que se define la pregunta biológica objeto de investigación y se selecciona el diseño experimental que mejor responda a los objetivos. La segunda etapa del experimento comienza una vez que las muestras se procesan e hibridan en los chips. Cuando se obtienen las imágenes fluorescentes, se inicia la etapa de procesamiento, en la que se analizan las imágenes para asignar los valores de expresión, y se aplican métodos estadístico-matemáticos que permitan cumplir los objetivos de la investigación. En este artículo se enfatiza en la metodología para la cuantificación y el análisis de los datos de expresión. Se describen los programas más utilizados para estos análisis y se proponen esquemas de trabajo para acometer algunos de los objetivos más frecuentes. Además, se comentan aplicaciones de esta tecnología en Oncología, donde ha habido avances en cuanto a: la clasificación de nuevos subtipos de cáncer, la identificación de nuevos blancos terapéuticos y la predicción de estadios de la enfermedad
Resumen en inglés The first step in a DNA microarray experiment is to define the biological question to be addressed and the selection of an appropriate experimental design. The experiment, however, does not end after the samples are processed and hybridized to the chips, since the fluorescent images that are its primary result have to undergo a data analysis process to assign expression values, using the mathematical-statistical methods suited to the goals of the study. Here a particular emphasis is made on the methodology used to quantify and analyze gene expression data. The most frequently used programs are briefly described and working plans are proposed for some of the most common experimental objectives. Additionally, we discuss and comment the applications of this technology in the field of Oncology, where it has enabled the discovery and classification of new cancer subtypes, and has helped to identify new therapeutic targets, as well as improving the prediction of disease stages
Disciplinas: Química,
Medicina
Palabras clave: Bioquímica,
Oncología,
Genética,
ADN,
Microarreglos genéticos,
Expresión génica,
Marcadores genéticos
Keyword: Chemistry,
Medicine,
Biochemistry,
Oncology,
DNA,
Genetic microarrays,
Gene expression,
Genetic markers,
Genetics
Texto completo: Texto completo (Ver PDF) Texto completo (Ver PDF)