Analysis of differentially expressed gene fragments in the head kidney of lipopolysaccharide-stimulated Malabar grouper (Epinephelus malabaricus)



Título del documento: Analysis of differentially expressed gene fragments in the head kidney of lipopolysaccharide-stimulated Malabar grouper (Epinephelus malabaricus)
Revista: Archivos de medicina veterinaria (Valdivia)
Base de datos: PERIÓDICA
Número de sistema: 000381950
ISSN: 0301-732X
Autors: 1
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Institucions: 1Hainan University, Haikou. China
Any:
Volum: 46
Número: 3
Paginació: 431-438
País: Chile
Idioma: Inglés
Tipo de documento: Artículo
Enfoque: Aplicado
Resumen en español Se estudiaron los efectos inmunológicos y el mecanismo molecular preliminar de lipopolisacáridos (LPS) en el mero malabárico ( Epinephelus malabaricus ). El mero se inyectó intraperitonealmente dos veces (con 7 días de diferencia) con 4 mg/kg –1 peso corporal de LPS provenientes de Escherichia coli (grupo de prueba, probadores) o solución de tampón fosfato pH 7,2 (grupo control, conductores). Veintiocho días después, la actividad media de antibacterianos, lisozima y polifenol oxidasa del suero mostraron valores de probador de 0,228, 0,032 y 21,8 U/ml x min, respectivamente, mientras que los valores de controlador fueron 0,200, 0,015 y 15,5 U/ml x min. Se elaboró una librería subtractiva de cDNA del riñón cefálico estimulado con LPS de mero malabárico utilizando hibridación substractiva por supresión. Se seleccionaron y secuenciaron 376 clones de fragmentos de genes expresados de probadores específicos, y se obtuvieron 326 EST calificados. Después de una búsqueda con los programas BLASTn y BLASTx, 312 ESTs mostraron gran similitud para 13 fragmentos de genes (14 ESTs no se asemejaron a ninguno de los genes en el GenBank). De los 13 fragmentos, dos (15,4%) estaban relacionados con inmunodefensa (factor 2 regulador de interferón-proteína de unión 2-A y complejo T de proteínas 1-theta); cinco (38,5%) estuvieron relacionados con la transcripción o la traducción; uno (7,7%) estuvo involucrado en el metabolismo (proteína CT054); dos (15,4%) codificarían homologoproteína de diferenciación, leucemia mieloide y la proteína 3 que contiene el dominio parche G; y tres (23,1%) eran genes de transporte de oxígeno que codifican la cadena α de hemoglobina, la cadena β de la hemoglobina y de la cadena pesada de ferritina. Los resultados mostraron que LPS podrían mejorar significativamente la inmunidad innata y regular la expresión de genes relacionados con la inmunidad, la producción de energía
Resumen en inglés The immunological effect and preliminary molecular mechanism of lipopolysaccharide (LPS) on Malabar grouper ( Epinephelus malabaricus ) were studied. The grouper was injected intraperitoneally twice (7 days apart) with 4 mg kg –1 body weight of LPS from Escherichia coli (test group; testers) or pH 7.2 phosphate buffer solution (control group; drivers). Twenty-eight days later, the mean antibacterial, lysozyme and polyphenol oxidase activities of the serum showed tester values of 0.228, 0.032 and 21.8 U/ml × min respectively, and driver values of 0.200, 0.015 and 15.5 U/ml × min. A subtracted cDNA library from the head kidney of LPS-stimulated Malabar grouper was constructed using suppression subtractive hybridization. A total of 376 clones from tester-specific expressed gene fragments were selected and sequenced, and 326 qualified expressed sequence tags (ESTs) were obtained. After searching with the BLASTn and BLASTx programs, 312 ESTs showed great similarity for 13 gene fragments (14 ESTs did not match any genes in the Genbank). Out of these 13 fragments two (15.4%) were related to immune defense (interferon regulatory factor 2-binding protein 2-A and T-complex protein 1-theta); five (38.5%) were related to transcription or translation; one (7.7%) was involved in metabolism (CT054 protein); two (15.4%) might encode myeloid leukemia differentiation protein homologue and G patch domain-containing protein 3; and three (23.1%) were oxygen transport genes that encode haemoglobin α chain, haemoglobin β chain and ferritin heavy chain. Results showed that LPS could significantly improve innate immunity and regulate the expression of genes related to immunity, cellular energy production, growth, metabolism and/or stress-resistance in Malabar grouper. Also, LPS could be used as an effective immunostimulant for this species and provided an insight to the mechanisms of the effects of LPS on aquatic animals at serological
Disciplines Medicina veterinaria y zootecnia
Paraules clau: Pesca,
Inmunología,
Mero,
Lipopolisacáridos,
Escherichia coli
Keyword: Veterinary medicine and animal husbandry,
Fisheries,
Immunology,
Grouper,
Lipopolysaccharides,
Escherichia coli
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