| Revista: | Acta scientiarum. Biological sciences |
| Base de datos: | PERIÓDICA |
| Número de sistema: | 000433829 |
| ISSN: | 1679-9283 |
| Autors: | Maia, Fabiano Rodrigo da1 Sujii, Patricia Sanae1 Goldenberg, Renato2 Silva Pereira, Viviane da2 Zucchi, Maria Imaculada3 |
| Institucions: | 1Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia, Campinas, Sao Paulo. Brasil 2Universidade Federal do Parana, Departamento de Botanica, Curitiba, Parana. Brasil 3Agencia Paulista de Tecnologia dos Agronegocios, Polo Centro-Sul, Piracicaba, Sao Paulo. Brasil |
| Any: | 2016 |
| Període: | Jul-Sep |
| Volum: | 38 |
| Número: | 3 |
| Paginació: | 327-332 |
| País: | Brasil |
| Idioma: | Inglés |
| Tipo de documento: | Artículo |
| Enfoque: | Analítico, descriptivo |
| Resumen en inglés | Tibouchina hatschbachii Wurdack(Melastomataceae) is an autogamous shrub restricted to granite (GO) and sandstone (SO) rock outcrops from subtropical Brazil. We designed primers for the amplification of microsatellite regions for T. hatschbachii, and characterized these primers to estimate genetic diversity parameters and contemporary genetic structure patterns. Eight loci were successfully amplified and were characterized using 70 individuals from three natural populations. Polymorphic information content ranged from 0.200 to 0.772 per locus. All loci were polymorphic, with allele numbers ranging from two to eight. The low degree of polymorphism may be explained by the fact that T. hatschbachii has disjunct populations and a recent genetic bottleneck, and also that it is self-pollinated. The observed and expected heterozygosities ranged from 0.115 to 1.000 and from 0.112 to 0.800, respectively. We observed private alleles in all loci. These are important features that enable us to identify population differentiation and help to us understand gene flow patterns for T. hatschbachii in subtropical Brazil. Eight microsatellite loci from other species of Tibouchina amplified positively in T. hatschbachii |
| Resumen en portugués | Tibouchina hatschbachii Wurdack (Melastomataceae) é um arbusto autógamo, com ocorrência restrita em afloramentos rochosos graníticos (GO) e areníticos (SO) na região subtropical do Brasil. Neste trabalho, foram desenvolvidos marcadores para a amplificação de regiões microssatélites para T. hatschbachiie caracterizados esses primers para estimar parâmetros de diversidade genética. Oito loci foram amplificados com sucesso e caracterizados, utilizando 70 indivíduos de três populações naturais. O conteúdo de informação polimórfica variou de 0,200 a 0,772 por locus. Todos os loci foram polimórficos, com números de alelos que variam de dois a oito. O baixo grau de polimorfismo pode ser explicado pelo fato de que T. hatschbachii possui populações disjuntas e uma história recente de gargalo genético populacional, e também pelo fato de apresentar um sistema reprodutivo de autopolinização, tendendo a favorecer a baixa variação. As heterozigosidades observadas e esperadas variaram entre 0,115-1,000 e 0,112-0,800, respectivamente. Também foi observada a presença de alelos privados em todos os loci. Estas são características importantes que nos permitirão identificar a diferenciação entre populações e poderão ajudar na compreensão dos padrões de fluxo gênico atual de T. hatschbachii na região subtropical do Brasil. Oito loci microssatélites de outras espécies de Tibouchina amplificaram positivamente em T. hatschbachii |
| Disciplines | Biología |
| Paraules clau: | Angiospermas, Genética, Especies endémicas, Genética de poblaciones, Microsatélites, Secuenciamiento génico, Tibouchina hatschbachii, Melastomataceae |
| Keyword: | Angiosperms, Genetics, Endemic species, Population genetics, Microsatellites, Gene sequencing, Tibouchina hatschbachii, Melastomataceae |
| Text complet: | http://periodicos.uem.br/ojs/index.php/ActaSciBiolSci/article/view/31496/pdf |
