Adaptación del algoritmo MARACAS para segmentación de la arteria carótida y cuantificación de estenosis en imágenes TAC



Título del documento: Adaptación del algoritmo MARACAS para segmentación de la arteria carótida y cuantificación de estenosis en imágenes TAC
Revista: Acta biológica colombiana
Base de datos: PERIÓDICA
Número de sistema: 000343062
ISSN: 0120-548X
Autors: 1
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Institucions: 1Universidad de los Andes, Grupo de Ingeniería Biomédica, Bogotá. Colombia
2Universite Claude Bernard Lyon 1, Villeurbanne, Rhone-Alpes. Francia
Any:
Període: Sep-Dic
Volum: 15
Número: 3
Paginació: 197-211
País: Colombia
Idioma: Español
Tipo de documento: Artículo
Enfoque: Aplicado, descriptivo
Resumen en español En este artículo se describen las adaptaciones hechas al algoritmo MARACAS para segmentar y cuantificar estructuras vasculares en imágenes TAC de la arteria carótida. El algoritmo MARACAS, que está basado en un modelo elástico y en un análisis de los valores y vectores propios de la matriz de inercia, fue inicialmente diseñado para segmentar una sola arteria en imágenes ARM. Las modificaciones están principalmente enfocadas a tratar las especificidades de las imágenes TAC, así como la presencia de bifurcaciones. Los algoritmos implementados en esta nueva versión se clasifican en dos niveles. 1. Los procesamientos de bajo nivel (filtrado de ruido y de artificios direccionales, presegmentación y realce) destinados a mejorar la calidad de la imagen y presegmentarla. Estas técnicas están basadas en información a priori sobre el ruido, los artificios y los intervalos típicos de niveles de gris del lumen, del fondo y de las calcificaciones. 2. Los procesamientos de alto nivel para extraer la línea central de la arteria, segmentar el lumen y cuantificar la estenosis. A este nivel, se aplican conocimientos a priori sobre la forma y anatomía de las estructuras vasculares. El método fue evaluado en 31 imágenes suministradas en el concurso Carotid Lumen Segmentation and Stenosis Grading Grand Challenge 2009. Los resultados obtenidos en la segmentación arrojaron un coeficiente de similitud de Dice promedio de 80,4% comparado con la segmentación de referencia, y el error promedio de la cuantificación de estenosis fue 14,4%
Resumen en inglés This paper describes the adaptations of MARACAS algorithm to the segmentation and quantification of vascular structures in CTA images of the carotid artery. The MARACAS algorithm, which is based on an elastic model and on a multi-scale eigen-analysis of the inertia matrix, was originally designed to segment a single artery in MRA images. The modifications are primarily aimed at addressing the specificities of CT images and the bifurcations. The algorithms implemented in this new version are classified into two levels. 1. The low-level processing (filtering of noise and directional artifacts, enhancement and pre-segmentation) to improve the quality of the image and to pre-segment it. These techniques are based on a priori information about noise, artifacts and typical gray levels ranges of lumen, background and calcifications. 2. The high-level processing to extract the centerline of the artery, to segment the lumen and to quantify the stenosis. At this level, we apply a priori knowledge of shape and anatomy of vascular structures. The method was evaluated on 31 datasets from the Carotid Lumen Segmentation and Stenosis Grading Grand Challenge 2009. The segmentation results obtained an average of 80:4% Dice similarity score, compared to reference segmentations, and the mean stenosis quantification error was 14.4%
Disciplines Matemáticas,
Medicina,
Ciencias de la computación
Paraules clau: Matemáticas aplicadas,
Diagnóstico,
Sistema cardiovascular,
Tomografía computarizada,
Algoritmos,
Arteria carótida,
Segmentación de imágenes,
Estenosis
Keyword: Mathematics,
Medicine,
Computer science,
Applied mathematics,
Cardiovascular system,
Diagnosis,
Computed tomography,
Algorithms,
Carotid artery,
Images segmentation,
Stenosis
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