| Journal: | Revista mexicana de fitopatología |
| Database: | PERIÓDICA |
| System number: | 000413989 |
| ISSN: | 0185-3309 |
| Authors: | Quispe Apaza, Cinthia Sheila1 Mansilla Samaniego, Roberto Carlos1 López Bonilla, César Fernando1 Espejo Joya, Rosa1 Villanueva Caceda, Juan1 Monzón, Criss1 |
| Institutions: | 1Universidad Nacional Agraria La Molina, La Molina, Lima. Perú |
| Year: | 2017 |
| Season: | Sep |
| Volumen: | 35 |
| Number: | 3 |
| Pages: | 418-436 |
| Country: | México |
| Language: | Español, inglés |
| Document type: | Artículo |
| Approach: | Experimental, aplicado |
| Spanish abstract | Se analizó la diversidad genética del patógeno del café Hemileia vastatrix, a través de secuenciación de los espaciadores internos transcribibles del ADN ribosomal (ITS). El análisis se realizó en muestras de roya de 12 predios de dos zonas cafetaleras del Perú, Quillabamba (Cusco) y Villa Rica (Pasco). Se hallaron los índices de diversidad haplotípica y nucleotídica. Además, se determinaron las semejanzas entre las poblaciones analizadas por medio de una red de haplotipos. Del análisis, se determinó que ambas regiones productoras presentan valores altos de diversidad genética; sin embargo, la zona de Quillabamba albergó la mayor diversidad haplotípica de H. vastatrix (Hd = 0.977+/- 0.012). Asimismo, la red de haplotipos permitió evidenciar la estructura de las poblaciones de H. vastatrix para cada zona, las que juntas se comportan como una gran población indiferenciada con presencia de haplotipos ancestrales a partir de los cuales se fueron generando nuevas variantes del hongo. También, se analizaron las secuencias de la región ITS de H. vastatrix peruanas y las almacenadas en el GenBank, no encontrándose distribución de las poblaciones por región geográfica; además, se determinó que las poblaciones de H. vastatrix peruanas presentan haplotipos similares a los de Colombia y a las razas II y XXII |
| English abstract | The genetic diversity of the coffee pathogen Hemileia vastatrix was analyzed by sequencing the internal transcribed spacer (ITS) of ribosomal DNA. The analysis was carried out using samples of rust pustules from 12 properties of two coffee areas in Peru, Quillabamba (Cusco) and Villa Rica (Pasco). Haplotype diversity indexes were found and the similarities among the populations analyzed were determined using a haplotype network. From the analysis, it was determined that both producing regions presented high values of genetic diversity, but Quillabamaba harbored the highest haplotype diversity of H. vastatrix (Hd = 0.977 +/- 0.012). In addition, the haplotype network showed the structure of H. vastatrix populations for these two areas, which behave as a large undifferentiated population with the presence of ancestral haplotypes from which new variants of the fungus were generated. We also analyzed the sequences of the ITS region of H. vastatrix collected in Peru and those reported in the GenBank, but we did not find any distribution of the populations by geographic region; it was also suggested that the populations of Peruvian rust presented haplotypes similar to those from Colombia and races II and XXII |
| Disciplines: | Agrociencias, Biología |
| Keyword: | Fitopatología, Plantas para uso industrial, Hongos, Hemileia vastatrix, Roya amarilla, Haplotipos, Coffea, ITS, Perú |
| Keyword: | Agricultural sciences, Biology, Phytopathology, Plants for industrial use, Fungi, Hemileia vastatrix, Yellow rust, Haplotypes, Coffea, ITS, Peru |
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