Predicción de rendimiento y firmeza de fruto de híbridos de tomate con BLUP y RR BLUP mediante marcadores moleculares ISSR



Document title: Predicción de rendimiento y firmeza de fruto de híbridos de tomate con BLUP y RR BLUP mediante marcadores moleculares ISSR
Journal: Revista Chapingo. Serie horticultura
Database: PERIÓDICA
System number: 000409410
ISSN: 1027-152X
Authors: 1
1
1
1
Institutions: 1Universidad Autónoma Chapingo, Departamento de Fitotecnia, Chapingo, Estado de México. México
Year:
Season: Ene-Abr
Volumen: 23
Number: 1
Pages: 21-33
Country: México
Language: Español, inglés
Document type: Artículo
Approach: Experimental, aplicado
Spanish abstract En el desarrollo de híbridos de tomate, un número grande de líneas progenitoras implica un número de híbridos posibles demasiado alto, y su formación y evaluación se vuelve un problema. La magnitud de éste puede reducirse a niveles manejables con el uso de métodos de predicción del desempeño de los híbridos. En el presente estudio se compararon dos métodos basados en huellas genómicas, teoría de los modelos mixtos y en la evaluación experimental de una muestra de híbridos: 1) el mejor predictor lineal insesgado o BLUP y 2) la regresión ridge BLUP. Se realizaron 36 cruzas simples con el objetivo de determinar el número, firmeza y rendimiento total y comercial de frutos. Con 1,000 muestras aleatorias independientes de tamaños, n = 6, 12, 18, 24 y 30, se predijo el comportamiento de los 36-n híbridos restantes. Los coeficientes de correlación entre valores predichos y observados fluctuaron entre 0.25 y 0.83. El BLUP de manera consistente registró los valores más altos. En ambos métodos de predicción cuando n aumentó la magnitud de las correlaciones también se incrementó
English abstract In the development of tomato hybrids, a large number of parental lines involves an excessively high number of possible hybrids, making their formation and evaluation problematic. The magnitude of this can be reduced to manageable levels with the use of hybrid performance prediction methods. In this study we compared two methods based on genomic fingerprints, mixed model theory and the experimental evaluation of a sample of hybrids: 1) best linear unbiased prediction or BLUP and 2) ridge regression BLUP. Thirty-six single crosses were performed with the objective of determining the number, firmness and total and commercial yield of fruits. With 1,000 size-independent random samples, n = 6, 12, 18, 24 and 30, the behavior of the remaining 36-n hybrids was predicted. The correlation coefficients between predicted and observed values ranged between 0.25 and 0.83. BLUP consistently recorded the highest values. In both prediction methods when n increased the magnitude of the correlations also increased
Disciplines: Agrociencias
Keyword: Hortalizas,
Jitomate,
Solanum lycopersicum,
Híbridos,
Marcadores moleculares,
ISSR,
Rendimiento,
Firmeza del fruto,
México
Keyword: Agricultural sciences,
Vegetables,
Tomato,
Solanum lycopersicum,
Hybrids,
Molecular markers,
ISSR,
Yield,
Fruit firmness,
Mexico
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