Molecular characterization using ISSR primers of Magnolia mexicana DC. from two regions in Zongolica, Veracruz, Mexico



Document title: Molecular characterization using ISSR primers of Magnolia mexicana DC. from two regions in Zongolica, Veracruz, Mexico
Journal: Revista Chapingo serie ciencias forestales y del ambiente
Database: PERIÓDICA
System number: 000424011
ISSN: 2007-4018
Authors: 1
1
2
1
Institutions: 1Universidad Autónoma Chapingo, Departamento de Fitotecnia, Texcoco, Estado de México. México
2Universidad Autónoma Chapingo, Departamento de Preparatoria Agrícola, Texcoco, Estado de México. México
Year:
Season: Sep-Dic
Volumen: 23
Number: 3
Country: México
Language: Español, inglés
Document type: Artículo
Approach: Experimental, analítico
Spanish abstract Introducción: Magnolia mexicana DC. es una especie amenazada según la NOM-059-SEMARNAT-2010, situación atribuida a la fragmentación y destrucción del hábitat. No existen estudios sobre la diversidad genética de M. mexicana, a pesar de que es endémica de nuestro país. Objetivo: Evaluar la variabilidad genética en dos poblaciones de M. mexicana mediante marcadores moleculares tipo ISSR. Materiales y métodos: Las colectas provienen de Amatitla y Zapotla en Zongolica, Veracruz. El ADN se extrajo de las hojas jóvenes. Se probaron 55 iniciadores ISSR, se seleccionaron los 10 que produjeron mayor número de bandas con polimorfismo y se amplificaron por PCR. Resultados y discusión: Los iniciadores ISSR mostraron 86 % de polimorfismo. El análisis de agrupamiento, con el método de varianza mínima de Ward, fue capaz de separar las colectas por su procedencia geográfica. El análisis de varianza molecular demostró que la mayor variabilidad (90.88 %) se encuentra dentro de cada población. El índice de diversidad de Shannon-Weaver fue de 0.47 y 0.41 para Amatitla y Zapotla, respectivamente. Conclusión: Las poblaciones de M. mexicana no han sufrido cambios en su estructura genética; no hay evidencia, a nivel genético, de alteraciones ocasionadas por la reducción de poblaciones o fragmentación del hábitat
English abstract Introduction: Magnolia mexicana DC. is a threatened species according to NOM-059-SEMARNAT-2010, a situation attributed to the fragmentation and destruction of its habitat. There are no studies on the genetic diversity of M. mexicana, even though it is endemic to our country. Objective: To evaluate genetic variability in two M. mexicana populations using ISSR molecular markers. Materials and methods: The collections come from Amatitla and Zapotla in Zongolica, Veracruz. The DNA was extracted from the young leaves. A total of 55 ISSR primers were tested; the 10 that produced the highest number of polymorphic bands were selected and amplified by PCR. Results and discussion: The ISSR primers showed 86 % polymorphism. Cluster analysis, using Ward's minimum variance method, was able to separate the collections by their geographical origin. Analysis of molecular variance showed that the greatest variability (90.88 %) is found within each population. The Shannon-Weaver diversity index was 0.47 and 0.41 for Amatitla and Zapotla, respectively. Conclusion: The M. mexicana populations have not undergone changes in their genetic structure; there is no evidence at genetic level of alterations caused by population reduction or habitat fragmentation
Disciplines: Biología
Keyword: Angiospermas,
Genética,
Magnolia mexicana,
Biología molecular,
ISSR,
Especies en peligro de extinción,
Fragmentación del hábitat,
Variabilidad genética,
Indice de Shannon-Weaver,
Veracruz,
México
Keyword: Angiosperms,
Genetics,
Magnolia mexicana,
Molecular biology,
ISSR,
Endangered species,
Habitat fragmentation,
Genetic variability,
Shannon-Weaver index,
Veracruz,
Mexico
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