Detection of genes providing salinity-tolerance in rice



Document title: Detection of genes providing salinity-tolerance in rice
Journal: Acta scientiarum. Biological sciences
Database: PERIÓDICA
System number: 000374910
ISSN: 1679-9283
Authors: 1
1
2
2
2
1
Institutions: 1Universidade Federal de Pelotas, Instituto de Biologia, Pelotas, Rio Grande do Sul. Brasil
2Universidade Federal de Pelotas, Faculdade de Agronomia Eliseu Maciel, Pelotas, Rio Grande do Sul. Brasil
Year:
Season: Ene-Mar
Volumen: 36
Number: 1
Pages: 79-85
Country: Brasil
Language: Inglés
Document type: Artículo
Approach: Experimental, aplicado
English abstract The present study aimed to identify salinity-tolerant genes in three cultivars (BRS-7 Taim, BRS Querência and BRS Atalanta) of Oryza sativa L. ssp. indica S. Kato and in three cultivars (BRS Bojurú, IAS 12-9 Formosa and Goyakuman) of Oryza sativa L. ssp. japonica S. Kato. Ten days after emergence seedlings were transferred to a greenhouse and placed in a 15L vessel with half strength Hoagland nutrient solution, which was changed every four days, under controlled temperature and humidity. Plants were harvested 56 days after transfer. DNA extraction was carried out by CTAB method and salinity-tolerant genes SOS and CK1 were identified by in silico research. Amplification of gene sequence was performed with in silico primers. Bands were detected by agar gel electrophoresis and visualized under ultraviolet light after staining with ethidium bromide. Gene SOS1 fragments were present in all cultivars, except in BRS Atalanta, whereas CK1 gene was present in all evaluated cultivars. Results show that salinity-tolerant genes under analysis were identified in the two sub-species
Portuguese abstract O estudo teve como objetivo identificar genes envolvidos na tolerância à salinidade em três cultivares (BRS-7 Taim, BRS Querência e BRS Atalanta) de Oryza sativa L. ssp. indica S. Kato e em três cultivares (BRS Bojurú, IAS 12-9 Formosa e Goyakuman) de Oryza sativa L. ssp. japonica S. Kato. As plântulas foram transferidas para casa de vegetação, sob temperatura e umidade relativa controladas, dez dias após a emergência e colocadas em bacia com capacidade para 15 litros, contendo solução nutritiva de Hoagland, meia força, a qual foi mudada em intervalos de quatro dias. A coleta foi aos 56 dias após a transferência. A extração de DNA foi realizada pelo método CTAB. Os genes SOS e CK1, envolvidos na tolerância à salinidade, foram identificados por meio de pesquisa in sílico. A amplificação das sequências do gene foi realizada utilizando-se primers também desenhados in sílico. As bandas foram detectadas por eletroforese em gel de agarose e visualizadas em luz ultravioleta após coloração com brometo de etídio. Fragmentos do gene SOS1 foram encontrados em todas as cultivares, exceto para BRS Atalanta. O gene CK1 esteve presente em todas as cultivares avaliadas. Os resultados mostram que os genes estudados estão presentes em ambas as subespécies
Disciplines: Biología,
Agrociencias
Keyword: Angiospermas,
Fisiología vegetal,
Genética,
Tolerancia a la salinidad,
Arroz,
Mejoramiento genético,
Amplificación génica
Keyword: Biology,
Agricultural sciences,
Angiosperms,
Genetics,
Plant physiology,
Salinity tolerance,
Rice,
Genetic improvement,
Gene amplification
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