High genetic connectivity and Population Expansion of Scomber japonicus in the Northern Humboldt Current System revealed by mitochondrial control region sequences



Document title: High genetic connectivity and Population Expansion of Scomber japonicus in the Northern Humboldt Current System revealed by mitochondrial control region sequences
Journal: Revista peruana de biología
Database: PERIÓDICA
System number: 000409489
ISSN: 1561-0837
Authors: 1
1
1
Institutions: 1Universidad Nacional Mayor de San Marcos, Facultad de Ciencias Biológicas, Lima. Perú
Year:
Season: May-Ago
Volumen: 24
Number: 2
Pages: 163-174
Country: Perú
Language: Inglés
Document type: Artículo
Approach: Analítico, descriptivo
Spanish abstract La caballa, Scomber japonicus soporta una pesquería importante en el Pacífico Sudeste, sin embargo, su genética de poblaciones se desconoce actualmente. En el presente estudio se examinó la estructura genética, el flujo génico y la demografía histórica de esta especie en la parte norte del Sistema de la Corriente de Humboldt. Las muestras fueron colectadas en los veranos del 2013 y 2014 en tres puntos de desembarco de pesca (Paita, Ventanilla e Ilo) cubriendo 12 grados de latitud frente a la costa peruana. Se secuenció un segmento de 532 pb de la región control mitocondrial en 72 individuos, el cual permitió detectar un total de 29 sitios polimórficos, 35 haplotipos, niveles moderados altos de diversidad haplotípica (0.793 – 0.969) y muy bajos niveles de diversidad nucleotídica (0.004 – 0.008). El análisis de flujo génico mostró altos niveles de conectividad entre las poblaciones en las áreas de muestreo. El análisis de varianza molecular ( Ф ST = 0.00868, P = 0.1837), las comparaciones Ф ST a pares de poblaciones y las pruebas de diferenciación genética confirmaron la carencia de estructuración genética entre las tres localidades. Estos análisis sugieren que los sitios de muestreo analizados pueden ser considerados como un solo grupo genético. El comportamiento migratorio, el alto potencial de dispersión de los estadios tempranos de desarrollo y la ausencia de barreras oceanográ - ficas pueden explicar su homogeneidad genética a lo largo del mar peruano. También se examinó la demografía histórica. Las pruebas de neutralidad, la distribución mismatch y el Bayesian Skyline Plot sugirieron un escenario de expansión poblacional que tuvo lugar durante el Pleistoceno Superior. Este estudio provee información nueva con respecto a la genética de poblaciones de la caballa en el Pacífico Sudeste
English abstract The chub mackerel, Scomber japonicus supports an important fishery in the Southeast Pacific, however, its population genetics is currently unknown. In the present study, we examined the genetic structure, the gene flow and the historical demography of this species in the Northern Humboldt Current System. Samples were collected during summer of years 2013-2014 from three fishing points (Paita, Ventanilla and Ilo), covering 12 degrees of latitude along the coast of Peru. A 532 bp segment of the mitochondrial control region was sequenced in 72 individuals, which allowed us to detect a total of 29 polymorphic sites, 35 haplotypes, moderate-to-high levels of haplotype diversity (0.793 – 0.969) and very low levels of nucleotide diversity (0.004 – 0.008). Gene flow analysis showed high levels of connectivity among populations in the sam - pling areas. Analysis of molecular variance ( Ф ST = 0.00868, P = 0.1837), population pairwise Ф ST comparisons and genetic differentiation tests confirmed the lack of genetic structuring among the three localities. These analyses suggest that sampling sites analyzed can be considered as a single gene pool. Migratory behavior, the high dispersal potential of early stages and the lack of oceanographic barriers may explain its genetic homogeneity along the Peruvian sea. Historical demography was also examined. Neutrality tests, mismatch distribution and Bayesian skyline plot suggested a population expansion scenario that took place during the Late Pleistocene. This study provides novel information on population genetics of the chub mackerel in the Southeast Pacific
Disciplines: Biología,
Demografía
Keyword: Genética,
Peces,
Características de la población,
Scomber japonicus,
Pacífico Sur,
Perú,
Genética de poblaciones,
Flujo génico
Keyword: Biology,
Demography,
Fish,
Genetics,
Demographics,
South Pacific,
Peru,
Population genetics,
Gene flow
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