Extracción y purificación de dsRNAs largos de plantas infectadas con virus y hongos aplicación en la detección e identificación de virus



Document title: Extracción y purificación de dsRNAs largos de plantas infectadas con virus y hongos aplicación en la detección e identificación de virus
Journal: Revista mexicana de fitopatología
Database: PERIÓDICA
System number: 000408916
ISSN: 0185-3309
Authors: 1
2
Institutions: 1Louisiana State University, Agricultural Center, Baton Rouge, Luisiana. Estados Unidos de América
2Universidad Nacional Autónoma de México, Facultad de Estudios Superiores Iztacala, Tlalnepantla, Estado de México. México
Year:
Season: Ene
Volumen: 35
Number: 1
Pages: 80-105
Country: México
Language: Español, inglés
Document type: Artículo
Approach: Descriptivo
Spanish abstract Se utilizan varios métodos para realizar la extracción y purificación de ARN de doble cadena (dsRNA) largo de plantas y hongos. Los protocolos más utilizados consisten en la extracción de fenol y la unión selectiva de dsRNA a la celulosa. Los dsRNAs virales purificados de plantas y hongos se han analizado por electroforesis con gel y se han utilizado como herramienta complementaria para identificar virus. Asimismo, los dsRNAs se han utilizado como reactivos en PCR de transcriptasa reversa, clonación molecular, preparación de sondas y secuenciación de virus ARN. Se han descubierto muchos virus ARN y moléculas subvirales que infectan plantas y hongos utilizando protocolos de extracción de dsRNA. Las recientes mejoras a los métodos de extracción de dsRNA han aumentado la eficiencia y la rentabilidad. Se ha comprobado que el dsRNA viral se puede utilizar como reactivo inicial para la secuenciación de próxima generación de genomas virales
English abstract Various methods for the extraction and purification of large dsRNAs are used to conduct detection and identification of viruses in plants and fungi. The most widely used protocol consists in phenol extraction and selective binding of dsRNA to cellulose. Purified viral dsRNAs from plants and fungi have been analyzed by gel electrophoresis and used as a complementary tool for virus identification. Moreover, dsRNAs have been used as reagent for reverse transcription PCR, molecular cloning, preparation of probes, and sequencing of RNA viruses. Many RNA viruses and subviral molecules infecting plants and fungi have been discovered using dsRNA extraction protocols. Recent improvements on dsRNA extraction methods have increased their efficiency, and cost effectiveness. It has been shown that viral dsRNA can be used as an initial reagent for next generation sequencing of viral genomes
Disciplines: Biología
Keyword: Genética,
Hongos,
Virus,
Genoma viral,
Virus de ARN
Keyword: Biology,
Fungi,
Genetics,
Virus,
Viral genome,
RNA virus
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