| Journal: | Revista mexicana de fitopatología |
| Database: | PERIÓDICA |
| System number: | 000405995 |
| ISSN: | 0185-3309 |
| Authors: | Ramírez Rojas, Sergio1 Ornelas Ocampo, Katya1 Osuna Canizalez, Felipe de Jesús1 Bartolo Reyes, Juan Carlos1 Varela Loza, Vicente1 Hernández Romano, Jesús2 Ochoa Martínez, Daniel Leobardo3 |
| Institutions: | 1Instituto Nacional de Investigaciones Forestales, Agrícolas y Pecuarias, Campo Experimental Zacatepec, Zacatepec, Morelos. México 2Universidad Politécnica del Estado de Morelos, Cuernavaca, Morelos. México 3Colegio de Postgraduados, Campus Montecillo, Montecillo, Estado de México. México |
| Year: | 2016 |
| Volumen: | 34 |
| Number: | 3 |
| Pages: | 308-315 |
| Country: | México |
| Language: | Español, inglés |
| Document type: | Nota breve o noticia |
| Approach: | Experimental |
| Spanish abstract | En el estado de Morelos recientemente se han observado enfermedades virales en cebolla (Allium cepa); una de ellas es la mancha amarilla causada por el Iris yellow spot virus perteneciente a la familia Bunyaviridae del género Tospovirus, el cual se trasmite a la cebolla por Thrips tabaci Lindeman (Thysanoptera: Thripidae). En el 2012 la incidencia de esta enfermedad fue de 100 % en las 2,500 ha cultivadas en la entidad con una severidad superior a 90 %. El objetivo de este trabajo fue detectar mediante RT-PCR en tiempo real y secuenciar la presencia de IYSV. Para su identificación se tomaron muestras de hojas de cebolla con manchas amarillentas alargadas, desde el trasplante hasta la cosecha en Tepalcingo, Morelos. La extracción de ARN total se realizó utilizando TRIzol® Reagent. La detección del virus se realizó con primers específicos al gen de la nucleoproteína de IYSV dando como resultado la amplificación de un producto específico mediante RT-PCR en tiempo real y una banda esperada de 896 pb la cual mediante secuenciación confirmó 99 % de identidad con el gen de la nucleoproteína de este virus. El IYSV fue detectado en plantas de cebolla en Tepalcingo, Morelos y su secuencia se registró en la base de datos del GenBank (JX946658) |
| English abstract | In Morelos state, recently have been observed viral diseases in onion (Allium cepa); one of them is caused by the Iris yellow spot virus (IYSV) which belong to the Bunyaviridae family and the Tospovirus gender and is transmitted by Thrips tabaci Lindeman (Thysanoptera: Thripidae) to onion plants. In 2012, there was a 100 % incidence of IYSV and severity of over 90 % on 2,500 ha of commercial crop. The objective of this research was to identify the presence of IYSV through real time RT-PCR and sequencing of the virus. To accomplish this, leaves were sampled from commercial fields at Tepalcingo, Morelos, from transplanting to harvest. Total RNA extraction was done with TRIzol® Reagent. Virus detection was done using specific primers for the nucleoprotein gen of IYSV giving as a result the amplification of a specific product through real-time RT-PCR, and an expected strip of 896 bp, which after sequencing confirmed 99 % identity with the nucleoprotein gen of the virus. The IYSV virus was detected in onion plants from Tepalcingo, Morelos and the sequence obtained was registered in the database of the GenBank (JX946658) |
| Disciplines: | Agrociencias, Biología |
| Keyword: | Fitopatología, Hortalizas, Virus, Cebolla, Allium cepa, RT-PCR, Tospovirus, Thrips tabaci, Morelos, México |
| Keyword: | Agricultural sciences, Biology, Phytopathology, Vegetables, Virus, Onion, Allium cepa, RT-PCR, Tospovirus, Thrips tabaci, Morelos, Mexico |
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