Incremento de la diversidad genética del Banco de Germoplasma de Nopal usando marcadores moleculares tipo RAPD



Document title: Incremento de la diversidad genética del Banco de Germoplasma de Nopal usando marcadores moleculares tipo RAPD
Journal: Phyton
Database: PERIÓDICA
System number: 000353429
ISSN: 0031-9457
Authors:
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Institutions: 1Universidad Autónoma de Nuevo León, Facultad de Agronomía, Monterrey, Nuevo León. México
2Universidad Autónoma Chapingo, Centro Regional Universitario Centro Norte, El Orito, Zacatecas. México
3Instituto Tecnológico y de Estudios Superiores de Monterrey, Monterrey, Nuevo León. México
Year:
Volumen: 81
Pages: 143-148
Country: Argentina
Language: Español
Document type: Artículo
Approach: Experimental, aplicado
Spanish abstract El objetivo de esta investigación fue incrementar la diversidad genética del Banco de Germoplasma de Nopal de la FAUANL utilizando marcadores moleculares del tipo RAPD para estimar la diversidad genética de 15 accesiones de nopal a partir de marcadores moleculares registrados en el Banco. La extracción de ADN se realizó por el método del ruptor celular usando el Kit FastDNA®. La cuantificación del rendimiento del ADN se realizó a través del Picoflour. Se observó que las concentraciones de ADN fluctuaron entre 74,91 ng/ μ L, y 12,32 ng/ μ L. Se usaron 12 iniciado - res generando de 1 a 5 bandas por iniciador con un peso molecular que fluctuó entre los 200 a 1000 pb. El índice de diversidad (ID) pro - medio de las 15 accesiones fue de 0,8539. Para el análisis de los datos moleculares se utilizó la matriz binaria de 20 marcadores registrados en el Banco, junto con los marcadores generados de las accesiones co - lectadas. Se utilizó el análisis de conglomerados jerárquico mediante el método de agrupamiento de pares no ponderados (UPGMA). El dendograma generado mostró claramente que no existe ninguna ac - cesión con distancia genética de cero, por lo cual se concluye que no existe duplicidad entre las accesiones mencionadas
English abstract The objective of this research was to increase the genet - ic diversity of the Nopal Germplasm Bank of the FAUANL using RAPD molecular markers to estimate the genetic diversity of 15 accessions of cactus pear from molecular markers recorded in the Bank. DNA extraction was performed by the method of cellular ruptor using FastDNA® Kit. Performance measurement of DNA was carried out through Picoflour. It was observed that the DNA concentrations ranged from 74.91 ng/ μ L to 12.32 ng/uL. Twelve primers were used to generate from 1 to 5 bands per primer with a molecular weight ranging from 200 to 1000 bp. The average diversity index (DI) of the 15 accessions was 0.8539. For the analysis of molecular data, it was used the binary matrix of 20 markers recorded in the bank, along with the markers generated from the collected accesions. We used cluster analysis by the method of unweighted pair-grouping (UP - GMA). The generated dendrogram showed clearly that there was no accession with a genetic distance of zero, and it was determined that there was no duplication among the mentioned accessions
Disciplines: Biología,
Agrociencias
Keyword: Angiospermas,
Genética,
Fitotecnia,
Nopal,
Mejoramiento genético,
Bancos de germoplasma,
Diversidad genética,
Marcadores moleculares
Keyword: Biology,
Agricultural sciences,
Angiosperms,
Genetics,
Crop husbandry,
Nopal,
Genetic improvement,
Germplasm banks,
Genetic diversity,
Molecular markers
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