Assessment of genetic diversity in maize inbred lines using RAPD markers



Document title: Assessment of genetic diversity in maize inbred lines using RAPD markers
Journal: CBAB. Crop breeding and applied biotechnology
Database: PERIÓDICA
System number: 000269921
ISSN: 1518-7853
Authors: 1
1
2
3
Institutions: 1Universidade Estadual de Londrina, Departamento de Agronomia, Londrina, Parana. Brasil
2Universidade Estadual de Londrina, Departamento Biologia, Londrina, Parana. Brasil
3Instituto Agronomico do Parana, Londrina, Parana. Brasil
Year:
Season: Jun
Volumen: 7
Number: 2
Pages: 173-178
Country: Brasil
Language: Inglés
Document type: Artículo
Approach: Experimental
English abstract RAPD molecular markers were used to analyze genetic diversity between 16 corn lines. Twenty-two primers were used resulting in the amplification of 265 fragments, of which 237 (84.44%) were polymorphic. Using the UPGMA method the genetic associations obtained showed 5 distinct heterotic groups. A principal coordinates analysis also showed an association of lines in 5 groups, in agreement with the results observed in the dendrogram. A bootstrap procedure was applied to verify whether the amount of markers used was sufficient to ensure reliability of the results, the procedure showed a coefficient of variation of 8.3%, suggesting that the markers were sufficient to assess genetic diversity between the analyzed lines. The high rate of polymorphism between lines revealed by RAPD markers indicated that the method is efficient to analyze genetic diversity in corn lines and that the genetic divergence can be used to establish consistent heterotic groups between corn lines
Portuguese abstract Marcadores moleculares RAPD foram utilizados para analisar a diversidade genética entre 16 linhagens de milho. Foram utilizados 22 primers que resultaram na amplificação de 265 fragmentos, dos quais 237 (84,44%) foram polimórficos. Usando o método de agrupamento UPGMA, as linhagens foram agrupadas em 5 grupos heteróticos distintos. Análise de coordenadas principais mostrou igualmente uma associação em 5 grupos, concordando com os resultados observados no dendrograma. O procedimento de bootstrap foi aplicado para verificar se a quantidade de marcadores utilizada foi suficiente para garantir a confiabilidade dos resultados, apresentando um coeficiente de variação de 8,3%, sugerindo que os marcadores foram suficientes para acessar a diversidade genética entre as linhagens analisadas. O alto polimorfismo revelado com os marcadores RAPD mostrou que o método é eficiente para a análise de diversidade genética em linhagens de milho e a divergência genética pode ser usada para estabelecer grupos heteróticos consistentes entre linhagens de milho
Disciplines: Agrociencias
Keyword: Fitotecnia,
Gramíneas,
Biotecnología,
Mejoramiento genético,
Maíz,
Zea mays,
Polimorfismo,
Marcadores genéticos
Keyword: Agricultural sciences,
Crop husbandry,
Gramineae,
Genetic improvement,
Corn,
Zea mays,
Polymorphism,
Genetic markers
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