Análisis de la diversidad genética de la mora (Rubus spp.) en el Departamento de Boyacá



Document title: Análisis de la diversidad genética de la mora (Rubus spp.) en el Departamento de Boyacá
Journal: Biotecnología en el sector agropecuario y agroindustrial
Database: PERIÓDICA
System number: 000400319
ISSN: 1692-3561
Authors: 1
1
1
1
2
Institutions: 1Universidad Pedagógica y Tecnológica de Colombia, Tunja, Boyacá. Colombia
2Universidad de los Llanos, Grupo de Investigación en Biotecnología, Villavicencio, Meta. Colombia
Year:
Season: Jul-Dic
Volumen: 14
Number: 2
Pages: 10-17
Country: Colombia
Language: Español
Document type: Artículo
Approach: Analítico, descriptivo
Spanish abstract Una muestra de 21 ecotipos genéticos de Rubus spp, se caracterizaron mediante marcadores Microsatélites Aleatorios RAMs. Los siete cebadores produjeron un total de 160 bandas polimórficas con pesos moleculares entre 350 y 1500 Kb. El análisis RAMs a un nivel de similitud del 55% diferenció a la población en cinco grupos en forma general de acuerdo con el sitio donde fueron colectados dichos ecotipos. El número de loci polimórficos varió de 16 (ACA) a 27 (CGA). Para la población total el porcentaje de loci polimórficos y la heterocigosidad promedio esperada (He) fueron de 88% y 0,29, respectivamente, más bajo que los encontrados en otros estudios de diversidad genética en el género Rubus; por lo tanto, se deben buscar estrategias para incrementar la variabilidad genética. El coeficiente de diferenciación genética (Fst) obtenido al evaluar los ecotipos de Rubus, con los siete marcadores microsatélites RAMs fue de 0,29 con una desviación estándar de 0,03, valores que muestran una alta diferenciación genética, la cual está asociada con el nivel de estructuración de la población que tiende a estabilizarse
English abstract A simple of 21 Rubus spp genetic ecotypes were characterized using markers Random Microsatellite RAMs. The seven primers produced a total of 160 polymorphic bands with molecular weights between 350 and 1500 Kb. RAMs analysis at a level of 55% similarity distinguished the population into five groups generally agree to the site where the ecotypes were collected. The number of polymorphic loci ranged from 16 (ACA) to 27 (CGA). For the total population the percentage of polymorphic loci and the expected average heterozygosity (He) were 88% and 0,29, respectively, much lower than values found in other genetic diversity studies in the genus Rubus. Therefore, strategies must be found to increase genetic variability. The coefficient of genetic differentiation (Fst) obtained in evaluating ecotypes Rubus, with seven RAMs microsatellite markers was 0,29 with a standard deviation of 0,03, values showing high genetic differentiation, which is associated with the level of population structure it tends to stabilize
Portuguese abstract Uma amostra de 21 ecótipos genéticos de Rubus spp, foram caracterizados por meio de marcadores microssatélites Aleatório RAM. Os sete iniciadores produzido para o total de 160 bandas polimórficas com pesos moleculares entre 350 e 1500 Kb. Análise RAMs a um nível de 55% de similaridade distinguiu a população em cinco grupos Geralmente concordar com o local onde os ecótipos foram coletados. O número de loci polimórficos variou de 16 (ACA) a 27 (CGA). Para a população em geral, a porcentagem de locos polimórficos e heterozigosidade média esperada (He) foram de 88% e 0,29, respectivamente, inferiores aos encontrados em outros estudos de diversidade genética do gênero Rubus. Portanto, as estratégias devem ser encontradas para aumentar a variabilidade genética. O coeficiente de diferenciação genética (FST) obtidos na avaliação de ecótipos Rubus, com sete carneiros marcadores microssatélites foi de 0,29, com um desvio padrão de 0,03, os valores mostrando uma diferenciação genética alta, que está associada com estrutura nível da população tende a estabilizar
Disciplines: Agrociencias,
Biología
Keyword: Frutales,
Genética,
Mora,
Rubus,
Diversidad genética,
Marcadores moleculares,
Microsatélites,
RAMs,
Colombia,
Boyacá
Keyword: Agricultural sciences,
Biology,
Fruit trees,
Genetics,
Blackberry,
Rubus,
Genetic diversity,
Microsatellites,
Rams,
Colombia,
Boyaca,
Molecular markers
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